夏代，寒浞在此建國(guó)，史稱(chēng)古寒國(guó)。漢王莽改古國(guó)為亭，始稱(chēng)寒亭，寒亭因此而得名。漢屬平壽縣，隋稱(chēng)濰水縣，唐改寒水縣。元稱(chēng)北海縣。明改濰縣，1984年建寒亭區(qū)。
　　1991年5月7日，經(jīng)濰坊市人民政府批準(zhǔn)，設(shè)立城區(qū)街道辦事處。1992年1月24日，撤銷(xiāo)東莊鄉(xiāng)，設(shè)立河灘鎮(zhèn)；撤銷(xiāo)里疃鄉(xiāng)，設(shè)立張氏鎮(zhèn)；撤銷(xiāo)郭家官莊鄉(xiāng)，設(shè)立郭家官莊鎮(zhèn)。
　　1994年5月23日，將郭家官莊鎮(zhèn)的李家朱茂、杜家朱茂、玄家朱茂、辛莊、王家潭里、小南潭、西金馬、東金麻8個(gè)村劃歸新設(shè)立的奎文區(qū)。
　　1998年，寒亭區(qū)面積781平方千米，人口35萬(wàn)。轄1個(gè)街道、9個(gè)鎮(zhèn)、3個(gè)鄉(xiāng)：城區(qū)街道、寒亭鎮(zhèn)、央子鎮(zhèn)、固堤鎮(zhèn)、高里鎮(zhèn)、河灘鎮(zhèn)、雙楊店鎮(zhèn)、朱里鎮(zhèn)、郭家官莊鎮(zhèn)、張氏鎮(zhèn)、泊子鄉(xiāng)、蕭家營(yíng)鄉(xiāng)、南孫鄉(xiāng)。區(qū)政府駐寒亭鎮(zhèn)。
　　2000年第五次人口普查，寒亭區(qū)總?cè)丝?55945人，其中：城區(qū)街道50564人，寒亭鎮(zhèn)37725人，固堤鎮(zhèn)29717人，央子鎮(zhèn)9389人，高里鎮(zhèn)30548人，雙楊店鎮(zhèn)32022人，朱里鎮(zhèn)30546人，張氏鎮(zhèn)22672人，郭家官莊鎮(zhèn)15051人，河灘鎮(zhèn)31207人，泊子鄉(xiāng)29401人，肖家營(yíng)鄉(xiāng)14217人，南孫鄉(xiāng)22886人。
　　截至2002年12月31日，全區(qū)總面積898平方千米。轄2個(gè)街道、6個(gè)鎮(zhèn)、2個(gè)鄉(xiāng)，409個(gè)行政村（居委會(huì)）。年底全區(qū)總?cè)丝?5.58萬(wàn)人,其中非農(nóng)業(yè)人口6.41萬(wàn)人。
　　2003年底，全區(qū)總面積872.3平方千米。人口33.88萬(wàn)人，其中非農(nóng)業(yè)人口7.55萬(wàn)人。轄2個(gè)街道、6個(gè)鎮(zhèn)、2個(gè)鄉(xiāng)：寒亭街道、開(kāi)元街道、固堤鎮(zhèn)、央子鎮(zhèn)、高里鎮(zhèn)、雙楊店鎮(zhèn)、朱里鎮(zhèn)、河灘鎮(zhèn)、泊子鄉(xiāng)、南孫鄉(xiāng)。共有375個(gè)行政村（居委會(huì)）。
　　2007年，撤銷(xiāo)央子鎮(zhèn)，設(shè)立央子街道；撤銷(xiāo)泊子鄉(xiāng)、固堤鎮(zhèn)，設(shè)立固堤街道；撤銷(xiāo)雙楊店鎮(zhèn)、南孫鄉(xiāng)，并入高里鎮(zhèn)；撤銷(xiāo)河灘鎮(zhèn)，并入朱里鎮(zhèn)。同時(shí)，將壽光市的大家洼街道劃歸寒亭區(qū)管轄。
　　2008年2月28日，濰坊濱海經(jīng)濟(jì)開(kāi)發(fā)區(qū)管委會(huì)正式開(kāi)會(huì)通告：根據(jù)濰坊市委、市政府的意見(jiàn)，將寒亭區(qū)央子街道辦事處委托濰坊濱海經(jīng)濟(jì)開(kāi)發(fā)區(qū)管理。