對(duì)RNA的科學(xué)研究,首先要從植物或者動(dòng)物等組織中提取出合格的RNA。在實(shí)際RNA提取中,有幾個(gè)提取原則:1、保證RNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性;2、提取的RNA樣品中不應(yīng)存在對(duì)酶存在壓制作用的有機(jī)溶劑及過(guò)高濃度的金屬離子;3、其他生物大分子如蛋白質(zhì)、多糖和脂類(lèi)分子的污染應(yīng)降低到較低程度;4、排除其它核酸分子(DNA)的污染。常用RNA提取方法有:1TRIzol法;2TRIzol+過(guò)柱法;3CTAB+過(guò)柱法;4試劑盒法。RNA提取試劑盒BiomarkerPlantTotalRNAIsolationKit(Polysaccharides&Polyphenolics–rich),能從植物組織,特別是富含多糖多酚或淀粉的植物組織(如成熟水稻葉片,棉花葉片,擬南芥種子,香蕉,馬鈴薯塊莖,蘋(píng)果,西瓜果肉,獼猴桃,梨,月季等)中快速提取總RNA,同時(shí)可以處理大量不同樣品。許多樣品中含有高水平的 RNase,這種酶也會(huì)加速 RNA 的降解。深圳RNA提取試劑廠(chǎng)家推薦
拭子RNA提取試劑的選擇?拭子樣本的量與提取的核酸量成正比,如果要提高核酸得率,也可通過(guò)增加樣本量來(lái)實(shí)現(xiàn)。一般先取一根拭子的涮洗液樣本,然后進(jìn)行提取,如結(jié)果不理想可考慮增加樣本量或重新采樣。但如果增加樣本量或重新采樣還不能得到滿(mǎn)意結(jié)果,應(yīng)及時(shí)考慮更換試劑盒。目前國(guó)內(nèi)常用的拭子核酸提取試劑有Q、Biog等。根據(jù)我們的經(jīng)驗(yàn),Q和T品牌試劑盒的拭子RNA提取得率(一根口腔拭子在口咽部來(lái)回刮擦10次)在0.5-3.5ug。同樣處理的口咽拭子,Biog試劑盒的提取得率在1-4ug,基本上都能滿(mǎn)足下游PCR相關(guān)實(shí)驗(yàn)的要求南京南昌RNA提取試劑RNA在260nm波長(zhǎng)處有較大的吸收峰。
目前,主流的RNA提取方法有Trizol法、離心柱法和磁珠法。其中,Trizol法與離心柱法相比,提取效果相當(dāng),但因其對(duì)操作者帶來(lái)的毒性,現(xiàn)在越來(lái)越被棄用。磁珠法可以針對(duì)大批量樣本處理,適合機(jī)器自動(dòng)化提取,但是提取核酸純度低,提取得率低,且使用成本較高。對(duì)于拭子RNA含量較低的樣本或比較珍貴的樣本或樣本總數(shù)不是很多的實(shí)驗(yàn)室,選擇的拭子RNA提取方法應(yīng)是離心柱法。近來(lái),隨著基因診斷技術(shù)的發(fā)展,從口腔拭子、泌尿生殖道拭子、痰液等樣本中進(jìn)行RNA提取的試劑盒的應(yīng)用價(jià)值越來(lái)越大,如tumour早期診斷、遺傳病檢測(cè)和病原體傳染核酸檢測(cè)等。拭子RNA提取效果在很大程度上取決于采樣質(zhì)量、試劑盒性能等,特別是試劑盒的性能較大影響了拭子核酸的基因檢測(cè)和各種研究的開(kāi)展。
RNA穩(wěn)定方法:1.在裂解緩沖液中立即溶解,使RNase失活。然后樣品可以立即處理或冷凍保存。2.浸泡在穩(wěn)定試劑中(如DNA/RNAShield),使核酸酶失活,并在環(huán)境溫度下長(zhǎng)時(shí)間保護(hù)核酸。這對(duì)正在實(shí)地收集樣本或處理珍貴的病人樣本(例如組織活檢、全血等)的研究人員特別有幫助。確保樣品完全溶解:在RNA提取過(guò)程中,較大限度地提高RNA產(chǎn)量和質(zhì)量的較佳方法是保證樣品的完全裂解。然而,并不是所有的樣本都對(duì)相同的裂解方案敏感。例如,血細(xì)胞(如淋巴細(xì)胞、PBMCs等)和微生物細(xì)胞往往更難以有效地溶解。光光添加基于洗滌劑的裂解緩沖液可能并不總是足夠的。為了提高裂解效果,可以將裂解緩沖液與機(jī)械裂解步驟(研磨珠破碎)匹配,或者在裂解液上游加入酶裂解步驟(如蛋白酶K、溶菌酶等)。可從全血,哺乳動(dòng)物細(xì)胞,細(xì)菌細(xì)胞和菌類(lèi)細(xì)胞中分離總RNA。
RNA是核糖核酸,DNA是脫氧核酸。區(qū)別:紫外吸收:核酸的λm=260nm,堿基展開(kāi)程度越大,紫外吸收就越厲害。當(dāng)A=1時(shí),DNA:50ug/ml,RNA和單鏈DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280還可來(lái)表示核酸的純度。沉降速度:對(duì)于拓?fù)洚悩?gòu)體(核苷酸數(shù)目相同的核酸),其沉降速度從達(dá)到小依次為:RNA;超螺旋DNA>解鏈環(huán)狀DNA;松弛環(huán)狀DNA;線(xiàn)形DNA也就是在離心管中較上層是線(xiàn)形DNA,較下面是RNA。電泳:核苷酸、核酸均可以進(jìn)行電泳,泳動(dòng)速度主要由分子大小來(lái)決定,因此,電泳是測(cè)定核酸分子量的好方法。DNA分子量測(cè)定較直接的方法:用適當(dāng)濃度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以將其他形式的DNA變成線(xiàn)形DNA,用電鏡測(cè)出其長(zhǎng)度,按B-DNA模型算出bp數(shù),根據(jù)核苷酸的平均分子量就可計(jì)算出DNA的分子量。β-巰基乙醇主要破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。深圳RNA提取試劑廠(chǎng)家推薦
血漿/血清RNA提取試劑盒:該試劑盒中的裂解液P1及柱結(jié)合液P2具有高效裂解及提取效果。深圳RNA提取試劑廠(chǎng)家推薦
RNA試劑盒:用于各種植物、動(dòng)物、微生物的RNA提取,在每個(gè)試劑盒里都有一份說(shuō)明使用說(shuō)明書(shū)。實(shí)驗(yàn)者只需要按照說(shuō)明書(shū)上的步驟操作即可。使用時(shí)無(wú)需配制其它試劑,非常方便,適合于RNA的快速提取。所提取的RNA完整性好、純度高,可用于分子生物學(xué)后實(shí)驗(yàn)。但較好的試劑盒價(jià)格比較貴,在實(shí)驗(yàn)室可以根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需要來(lái)定奪試劑盒的使用。注意事項(xiàng)所有相關(guān)器皿耗材都應(yīng)為RNase-free產(chǎn)品,操作過(guò)程要小心,帶口罩、手套避免環(huán)境中RNA酶污染樣品。RNA在水溶液中OD值可能在1.5-1.9之間,但這并不表示RNA不純,需電泳檢測(cè)。深圳RNA提取試劑廠(chǎng)家推薦