RNA提取試劑的選擇:選擇合適的提取試劑是較重要的一步。好的提取試劑在確保成功的同時,操作方便且經(jīng)濟(jì)實用。對于動物組織、簡單的植物材料、各種微生物、培養(yǎng)細(xì)胞的totalRNA提取,Takara公司的RNAisoPlus具有諸多的成功案例。隨著2013年7月柱型提取試劑TaKaRaMiniBESTUniversalTotalRNAExtractionKit的成功上市,進(jìn)一步豐富了TakaraRNA提取的產(chǎn)品線。該產(chǎn)品采用了獨特的細(xì)胞裂解系統(tǒng),無需苯酚氯仿抽提等步驟,簡單快捷。組織或細(xì)胞裂解后,提取操作光需20分鐘便可完成RNA提取試劑注意事項:所有離心管,泵頭及相關(guān)溶液都必須無RNA酶污染。無錫正規(guī)RNA提取試劑生產(chǎn)廠家
植物RNA提取:植物組織中,富含酚類化合物,或富含多糖,或含有某些尚無法確定的次級代謝產(chǎn)物,或RNase的活性較高。這些物質(zhì)在細(xì)胞裂解后與RNA緊密結(jié)合形成難溶復(fù)合物或者膠狀沉淀,很難將其去除。所以我們在提取植物組織時,要選取針對植物的試劑盒,試劑盒里的裂解液能有效解決多酚易氧化、多糖化合物與核酸分離等難題。1、植物的果皮、果肉、種子、葉片等要在研缽中充分研磨,研磨過程中液氮要及時補充,避免樣品融化,研磨后的樣品應(yīng)迅速加入裂解液中震蕩混勻,避免RNA降解。2、像水稻及小麥葉片等富含纖維的樣本,則應(yīng)適當(dāng)減少提取用量,否則組織研磨及裂解不徹底,會使提取的RNA產(chǎn)量較低。3、含水分較多的植物組織例如石榴果實、西瓜果實、桃子果實等則應(yīng)當(dāng)適當(dāng)提高樣本量(可選100~200mg)。4、植物組織,如植物葉片、根莖、堅硬的果實等材料一般建議使用液氮在研缽中徹底研缽成份,再繼續(xù)進(jìn)行提取步驟。常規(guī)的組織勻漿機(jī)對植物組織的勻漿效果可能不佳,一般不建議使用。武漢RNA提取試劑服務(wù)電話RNase主要來自樣品的細(xì)胞。
眾所周知,RNA提取是一項困難的工作。常見的挑戰(zhàn)包括RNA降解、低產(chǎn)率和/或純度以及DNA污染。此外,不同的樣品類型有自己獨特的特性,需要特別注意。例如,微生物(如革蘭氏陽性/陰性細(xì)菌、菌類、古生菌等)的細(xì)胞壁堅硬,不易被化學(xué)和酶解。其他樣本類型,如糞便和植物含有壓制劑(如多酚類、腐殖酸/黃腐酸、單寧酸等),可與RNA共沉淀,并可壓制下游分析,如RT-qPCR。RNA是不穩(wěn)定的,極易降解。許多樣品含有高水平的RNase,會快速降解RNA。為了使之較小化,較好在采集時穩(wěn)定樣本中的RNA。常用的樣品穩(wěn)定方法包括液氮快速冷凍、干冰乙醇浴或-80°C冷凍室。然而,這些方法也有缺點,如核酸的凍融損傷,并不是所有的研究人員在采集樣品時都能立即使用這些方法。
rRNA是細(xì)胞內(nèi)的一種基本RNA,與r蛋白一起構(gòu)成蛋白質(zhì)合成的場所—核糖體。隨著rRNA基因序列越來越了解,其在生物研究中也的得到了更普遍的應(yīng)用,主要表現(xiàn)在生物進(jìn)化研究和分子流行病研究。(1)rRNA在生物進(jìn)化上的研究。rRNA具有高度保守性,且普遍存在于各種生物中,rRNA提供了足夠的序列信息。現(xiàn)在還可用于在細(xì)菌分類、細(xì)菌鑒定等方面。(2)rRNA在分子流行病上的研究。目前,人們已經(jīng)把rRNA在進(jìn)化上的普遍差異應(yīng)用到了流行病學(xué)研究方面,通過對不同細(xì)菌進(jìn)行鑒定分類,從而明確病因,追蹤傳染源,進(jìn)一步控制及預(yù)防疾病。RNA由核糖核苷酸經(jīng)磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。
昆蟲RNA柱式提取試劑盒使用方法:將一半的溶液轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,12000rmp室溫離心半分鐘,棄穿透液。將剩下的一半溶液轉(zhuǎn)移到同一離心吸附柱中,12000rmp室溫離心半分鐘,棄穿透液。加0.7mL通用洗柱液,室溫12000rmp離心半分鐘,棄穿透液。加0.3mL通用洗柱液,室溫12000rmp離心半分鐘,棄穿透液。此步可以省略。室溫12000rmp離心半分鐘。此步十分重要,否則殘留的乙醇會影響RNA的使用。將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到RNase-free收集管中,加入50~100μLRNA洗脫液,室溫放置1~2分鐘。12000rmp室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為RNA樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用~RNA提取試劑注意事項:其它器物去除RNA酶可考慮用0.01%的DEPC水浸泡過夜,滅菌,烘干。無錫正規(guī)RNA提取試劑生產(chǎn)廠家
即用型RNA,可在絕大多數(shù)下游應(yīng)用。無錫正規(guī)RNA提取試劑生產(chǎn)廠家
Trizol是一種總RNA抽提試劑,內(nèi)含異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速裂解細(xì)胞,壓制細(xì)胞釋放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法進(jìn)行提取組織或細(xì)胞中的RNA。原理:在勻質(zhì)化或溶解樣品中,Trizol試劑可保持RNA的完整性,同時能破壞細(xì)胞及溶解細(xì)胞成分。加入氯仿離心后,裂解液分層成水相和有機(jī)相。RNA存在于水相中。水相轉(zhuǎn)移后,RNA通過異丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可從中間相沉淀得到DNA,加入異丙醇沉淀可從有機(jī)相得到蛋白質(zhì)。異硫氰酸胍氯化銫超速離心法:原理:使用蛋白質(zhì)變性劑異硫氰酸胍有效壓制RNA酶的活性,經(jīng)過起始密度為1.78g/ml的氯化銫介質(zhì),進(jìn)行密度梯度超速離心,RNA沉淀于管底,而DNA與蛋白質(zhì)在上清液中。使用這種方法,不但能得到高質(zhì)量的RNA,而且能同時分離出細(xì)胞染色體DNA。無錫正規(guī)RNA提取試劑生產(chǎn)廠家