Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進行mRNA表達量的測定,采用染料法是比較經濟實惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產物特異性的情況;目的基因和內參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應用于病毒RNA的檢測;以及單位點突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個反應中同時檢測目的基因和內參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實時熒光定量PCR技術(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術基...
Real-timePCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產物擴增,低則合成產物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結合。引物長度在15~25時退火溫度。實時熒光定量PCR通過內參或者外參法對待測樣品中的特定...
Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環結合使蛋白質變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,它和RNA酶結合形成過渡態類物質,幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,...
Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應體系中,加入過量SYBR螢光染料,SYBR螢光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發射螢光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發射任何螢光信號,從而保證螢光信號的增加與PCR產物的增加完全同步。此方法適用于:1、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強到1000倍以上。2、通用性好,不需要設計探針,方法簡便,省時,價格低廉。3、通用型方法,在國內外科研中普遍使用。4、高通量大規模的定量PCR檢測。5、專一性要求不高的定量PCR檢測。Real-time PCR可看作是生物體外的特殊DNA復制。上海實時Real-time PCR服務Real-tim...
Real-time PCR鏈反應:嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景,提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續的PCR。在個反應中,一對引物用于產生DNA產物,除了預期的靶之外,該產物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產物用于第二次聚合酶鏈反應,所述引物的結合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統PCR更成功,但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。它用于連接含有基因、調節...
Real-time PCR:使用Real-time PCR進行基因檢測,被普遍應用于病毒和病原菌檢測、轉基因食品檢測、遺傳病基因檢測等領域。一般首先需要利用專業使用的試劑盒從待檢樣品中提取其核酸(DNAorRNA),并經過精制等復雜的操作(通常稱為前處理操作)之后才可以進行Real-time PCR。不易受反應阻害物的影響,使用時不需要進行復雜的前處理操作,單單需將待檢樣品直接加入到檢測試劑中即可開始檢測。通過使用本產品,可以在更短的時間內,簡便、低成本地進行Real-time PCR檢測。實時熒光定量PCR是一種采用外標準曲線定量的方法。無錫細胞數字PCR應用Real-time PCR鏈式反...
聚合酶鏈式反應的試驗污染:PCR反應的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產生。污染原因:標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內...
Real-time PCR相對定量中的標準曲線法如何進行:主要是相對定量標準品的制作,一般有三種方法:1、比較復雜的方法:質粒,采用Biotnt提供內參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對目的基因進行Real-time PCR實驗,得到PCR擴增產物;PCR擴增產物轉入質粒中,得到相對定量的標準品;2、一般采用的方法1:比較強的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR擴增產物,如果在方法2中找不到比較強的CDNA模板,則選用PCR產物作為相對定量的標準品也是可以的;需要注意的事項是:PCR產物濃度很高,而Real-time PCR的產物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR...
Real-time PCR鏈式反應的特點:靈敏度高:PCR產物的生成量是以指數方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速:PCR反應用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應,一般在2~4小時完成擴增反應。擴增產物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養細胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板。...
Real-time PCR反應:多重連接依賴探針擴增(MLPA):允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應:由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產生對不同DNA序列特異的不同大小的擴增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執行。每個引物組的退火溫度必須優化,以在單個反應中正確工作,并符合擴增子尺寸。也就是說,當通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應該足夠不同以形成不同的條帶。實時熒光定量PCR技術有效地解決了傳統定量只能終點檢測的局限。徐州血液熒光PCR方案Real-time PCR從用途上分可以分為...
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉基因動植物轉基因拷貝數的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達差異分析:例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等),特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA晶片或差顯結果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。Real-time PCR探針法具有高適應性和可靠性。廈門組織定量PCR原理實時熒光定量PCR...
Real-time PCR鏈反應:嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景,提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續的PCR。在個反應中,一對引物用于產生DNA產物,除了預期的靶之外,該產物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產物用于第二次聚合酶鏈反應,所述引物的結合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統PCR更成功,但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。它用于連接含有基因、調節...
所謂real-timeQ-PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實時監測整個PCR進程,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。在real-time技術的發展過程中,兩個重要的發現起著關鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發現,它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產物成為可能。(2)此后熒光雙標記探針的運用使在一密閉的反應管中能實時地監測反應全過程。這兩個發現的結合以及相應的儀器和試劑的商品化發展導致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運用。Real-time PCR的基本目標是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸。溫州...
引物的設計對于這個實驗至關重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規PCR,引物同源性不高,只要兩條產物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。在PCR產物中,由于內標與靶模板的長度不同。深圳血液定量PCR方案Real-time PCR:基線(bas...
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉基因動植物轉基因拷貝數的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達差異分析:例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等),特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA晶片或差顯結果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。實時熒光定量PCR實現了每一輪循環均檢測一次熒光信號的強度。莆田微量數字PCR供應商聚合酶鏈式...
聚合酶鏈反應注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴增,必須設陰性對照;內參的設定主要為了用于靶RNA的定量。常用的內參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進入平臺期,出現平臺效應與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結構以及目標DNA起始的數量有關。故對于每一個目標序列出現平臺效應的循環數,均應通過單獨實驗來確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可...
引物的設計對于這個實驗至關重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規PCR,引物同源性不高,只要兩條產物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。實時熒光定量PCR是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質測聚合酶鏈式反應循環后產物總量的方法。南通特殊樣...
Real-time PCR鏈式反應的常見問題:靶序列變異:如靶序列發生突變或缺失,影響引物與模板特異性結合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補序列,其PCR擴增是不會成功的。假陽性:出現的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現假陽性。需重新設計引物。出現片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環次數過多引起。其對...
聚合酶鏈式反應生物學研究的歷史中占據了重要的地位。以此為基礎發展出包括Real-time PCR在內的多項應用技術。自誕生后Real-time PCR技術持續發展,從簡單的增擴到整個PCR過程,Real-time PCR表現出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環增擴曲線的增長。事實并非如此,早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數據執行數據分析工作,而不是分析每個單獨的反應循環。對某些設備來說,必須向分析軟件提供實時的數據,有些設備則不需要。前一種設備允許軟件實...
Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進行mRNA表達量的測定,采用染料法是比較經濟實惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產物特異性的情況;目的基因和內參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應用于病毒RNA的檢測;以及單位點突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個反應中同時檢測目的基因和內參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實時熒光定量PCR技術(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術基...
PCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產物擴增,低則合成產物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結合。引物長度在15~25時退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現的,這些酶在環境溫度下...
Real-time PCR操作流程:1、收集樣品。2相關試劑總RNA提取試劑TREzolReagent(RNA提取試劑),M-MLV(cDNA逆轉錄酶),RNA純化試劑,RealqPCRMasterMix(螢光定量PCR預混試劑)。3實驗儀器螢光定量PCR儀;PCR儀;低溫離心機。4總RNA提取。5cDNA合成在0.5ml的離心管中加入1µl模板總RNA(1µg/µl);Real-time PCR操作流程:2µl隨機引物(T18,10pmol/ul);2µl10mMdNTPmix;加水至15µl體系。混勻后70℃變性RNA...
Real-time PCR-傳統定量PCR:1)內參照法:在不同的PCR反應管中加入已定量的內標和引物,內標用基因工程方法合成。上游引物用熒光標記,下游引物不標記。在模板擴增的同時,內標也被擴增。在PCR產物中,由于內標與靶模板的長度不同,二者的擴增產物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,以內標為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產生的含有一個新內切位點的外源競爭性模板。在同一反應管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標記)。實時熒光定量PCR通過內參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。常州特殊樣本定量PCR原理Real-...
聚合酶鏈式反應又稱多聚酶鏈式反應,是一項利用DNA雙鏈復制的原理,在生物體外復制特定DN段的核酸合成技術。透過這項技術,可在短時間內大量擴增目的基因,而不必依賴大腸桿菌或酵母菌等生物體。聚合酶鏈反應是是一種簡單,廉價和可靠的方法復制DN段,這個概念適用于現物學和相關科學的許多領域。PCR可能是分子生物學中使用很較廣的技術。這種技術被用于生物醫學研究,犯罪取證和分子考古學。通常,PCR由一系列20-40次重復的溫度變化組成,稱為熱循環,每個循環通常由兩個或三個離散的溫度步驟組成。聚合酶鏈式反應準備:引物內部不應出現互補序列。實時熒光定量PCR技術有效地解決了傳統定量只能終點檢測的局限。上海血液R...
聚合酶鏈式反應的試驗污染:PCR反應的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產生。污染原因:標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內...
PCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產物擴增,低則合成產物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結合。引物長度在15~25時退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現的,這些酶在環境溫度下...
引物的設計對于這個實驗至關重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規PCR,引物同源性不高,只要兩條產物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。Real-time PCR探針法具有高適應性和可靠性。連云港組織熒光PCRReal-timePCR的反應條...
聚合酶鏈式反應的試驗污染:陽性對照,在建立PCR反應實驗室及一般的檢驗單位都應設有PCR陽性對照,它是PCR反應是否成功、產物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志。陽性對照要選擇擴增度中等、重復性好,經各種鑒定是該產物的標本,如以重組質粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質粒及高濃度陽性標本,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大。因而當某一PCR試劑經自己使用穩定。實時熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略。深圳血液熒光定量PCR原理Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEP...
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉基因動植物轉基因拷貝數的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達差異分析:例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等),特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA晶片或差顯結果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。實時設備的軟件能使收集到的數據進行正常化處理來彌補背景熒光的差異。莆田組織熒光定量PCR技術服...
聚合酶鏈式反應:因為PCR擴增了目的DNA區域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對于法醫檢定法,當時只有微量的DNA可作為證據。聚合酶鏈反應也可用于分析古代DNA那已經有數萬年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應的技術已經成功地應用于動物身上,例如四萬年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應或者實時聚合酶鏈反應不要與逆轉錄-聚合酶鏈反應方法混淆)允許估計樣品中存在的給定序列的量——這種技術通常用于定量確定基因表達的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測量每輪PCR擴增后DNA產物的積累。聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。實時熒光定量PCR是一種在DNA擴增反應中,以...