Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析：定量分析可以分為定量和相對定量兩種。定量指的是我們想知道某個基因在初始樣品中具體的拷貝數或濃度是多少？定量實驗必須使用已知拷貝數的標準品，必須做標準曲線。而相對定量是指我們想知道某一個基因在不同樣品中表達量的差異，其目的是測定目的基因在兩個或多個樣本中的含量的相對比例，而不需要知道它們在每個樣本中的拷貝數。舉例來說，如研究項目中包括使用高鹽脅迫處理的樣本和未高鹽脅迫處理的樣本，記為已處理樣本和未處理樣本，通常可以將未處理樣本指定為基準，規定其目的基因濃度為100%，用已處理樣本的定量結果除以未處理樣本的定量結果，就可以計算每個已處理樣本的基因含量相對于未處理樣本的百分比。相對定量可以應用于差異顯示結果驗證、基因芯片結果驗證、siRNA效果確認、mRNA表達量分析等等。電子PCR被提出作為分子生物學的教育工具。武漢分子生物學RT-PCR檢測技術哪家好

Real-time PCR：1.DNA或RNA的定量分析：Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉基因動植物轉基因拷貝數的檢測，RNAi基因失活率的檢測等；2.基因表達差異分析：例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等)，特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA晶片或差顯結果的確證；3.基因分型：例如SNP檢測，甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen（螢光染料摻入法）和Taqmanprobe（探針法）。武漢分子生物學RT-PCR檢測技術哪家好PCR反應的特異性決定因素為：引物與模板DNA特異正確的結合。

Real-time PCR雙熒光標記探針設計原則：具體的其他要求可以具體聯系設計公司，拿到合成好的引物，需要先確認引物的性能。可以用這對引物先擴增梯度稀釋后的標準品（標準品介紹見后續內容）。由不同梯度標準品的加量和其對應的Ct值，描繪出一條標準曲線。這里要注意根據標準曲線得到的參數是非常重要的。引物性能確認：1.決定系數R2大于0.98，越接近于1，結果越可靠。2.擴增效率一般要求在0.8-1.2，越接近于1，越好。3.檢測的靈敏度，必須確認，通常要求35個循環以內，一般可以得到比較好的定量結果，30個循環以內，沒有非特異性擴增產生。4.NTC是必須要確認的，通常要求30個循環內沒有引物二聚體產生。

引物的設計注意事項：1，引物設計要跨內含子，不能在一個外顯子上（我們的實驗是以cDNA為模板來擴增的，如果有DNA污染的話，因為DNA上含有分子量很大的內含子，不可能完成擴增。這對我們消除整個實驗的誤差起很大的作用）。2，引物設計的時候要盡可能設計在同一退火溫度，方便于以后同時擴增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大，就得分開做，浪費模板，浪費管家基因，所以每個實驗室設計引物的時候要盡可能一致，這樣就不用每次查退火溫度，且對整個實驗有利。Real-time PCR探針法實驗結果穩定重複性好，特異性更高。

Real-time PCR-傳統定量PCR：擴增后用內切酶消化PCR產物，競爭性模板的產物被酶解為兩個片段，而待測模板不被酶切，可通過電泳或高效液相將兩種產物分開，分別測定熒光強度，根據已知模板推測未知模板的起始拷貝數。PCR－ELISA法：利用地高辛或生物素等標記引物，擴增產物被固相板上特異的探針所結合，再加入抗地高辛或生物素酶標抗體－辣根過氧化物酶結合物，之后酶使底物顯色。常規的PCR－ELISA法只是定性實驗，若加入內標，作出標準曲線，也可實現定量檢測目的。實時設備的軟件能使收集到的數據進行正常化處理來彌補背景熒光的差異。武漢分子生物學RT-PCR檢測技術哪家好

實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數較敏感、較準確的方法。武漢分子生物學RT-PCR檢測技術哪家好

Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑：1.焦磷酸二乙酯（DEPC）：是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環結合使蛋白質變性，從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍：目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑，它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從蛋白中解離出來，又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復合物：由氧化釩離子和核苷形成的復合物，它和RNA酶結合形成過渡態類物質，幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑（RNasin）：從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑，可以和多種RNA酶結合，使其失活。5.其它：SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。武漢分子生物學RT-PCR檢測技術哪家好

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