與IdeS不同，為了獲得更均勻的度拉糖肽融合蛋白的消化產(chǎn)物，用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白質(zhì)消化該蛋白質(zhì)，該蛋白由與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的GlySERIAS酶組成。通過將酶偶聯(lián)到樹脂上，可以增加酶與蛋白質(zhì)的比率，從而可以進(jìn)一步加速反應(yīng)，以獲得更完整的連接子消化。此外，該酶不會(huì)存在于樣品制備中，可能會(huì)干擾樣品分析。為了進(jìn)行比較，度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化過夜，或用GlySERIAS凍干1小時(shí)并在37°C下過夜消化。 為了降低樣品復(fù)雜性，使用內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR凍干去除Fc聚糖，并減少鏈間二硫鍵。通過反相LC-MS對(duì)樣品的分析表明，GlySERIAS Immobilized幾乎完全消化了Fc結(jié)構(gòu)域中的連接子，留下了接近均質(zhì)的Fc/2產(chǎn)物，其中含有來自連接子的一個(gè)絲氨酸殘基。用 GlySERIAS 凍干 1 小時(shí)或過夜消化，兩者都會(huì)產(chǎn)生幾種 Fc 產(chǎn)物，并附著不同數(shù)量的絲氨酸和甘氨酸殘基。GLP-1肽在所有三個(gè)樣品中以兩種變體存在。使用GlySERIAS固定化消化的均質(zhì)Fc/2能夠詳細(xì)研究特定于Fc區(qū)域的質(zhì)量屬性。此外，在樣品中未觀察到干擾分析的酶峰。作為補(bǔ)充，F(xiàn)c/2 產(chǎn)物在用 GlySERIAS 凍干消化后殘留部分連接子，有助于研究位于 GS 連接子的修飾。為Fc聚糖分析提供了一種快速、直接的、自動(dòng)化，高通量的替代方法。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

不同于IdeS，Genovis的FabDELLO 是一種蛋白酶，可在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人 IgG1，在兩小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生完整的 Fab 和 Fc 片段，無需還原條件。該酶對(duì)具有突變鉸鏈區(qū)域的抗體（如 LALA 突變）具有活性，并啟用中級(jí) LC-MS 來表征具有突變鉸鏈的抗體的關(guān)鍵質(zhì)量屬性。FabDELLO 在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人 IgG1 （...KSCDK / THTCPPCP...），生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一種賴氨酸特異性蛋白酶。單個(gè)消化位點(diǎn)是人 IgG1 的三維結(jié)構(gòu)的結(jié)果，使這種賴氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖，則Fc上暴露的賴氨酸處可能會(huì)出現(xiàn)額外的消化位點(diǎn)。FabDELLO在天然條件下具有活性，需要鈣離子的存在。在37°C和pH 7-8.5下獲得良好活性。FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細(xì)菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 32 kDa。陜西GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶通過將酶偶聯(lián)到樹脂上，可以增加酶與蛋白質(zhì)的比率，從而可以進(jìn)一步加速反應(yīng)，以獲得更完整的蛋白質(zhì)的消化。

與IdeS不同，Genovis的GlySERIAS是一種獨(dú)特的酶，可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白連接子，例如Gly4Ser和GlyxSery（GS）以及聚甘氨酸（G）接頭。該酶能夠分離多功能融合蛋白的各個(gè)結(jié)構(gòu)域，以促進(jìn)表征并增加對(duì)這些分子的理解。融合蛋白的中級(jí)分析既可以降低整體樣品的復(fù)雜性，又可以對(duì)翻譯后修飾進(jìn)行結(jié)構(gòu)域特異性鑒定和監(jiān)測(cè)。為了改善連接子的去除，Genovis建議使用GlySERIASImmobilized。對(duì)于連接子表征，我們推薦GlySERIAS凍干。具有柔性接頭的獨(dú)特酶消化融合蛋白；中級(jí)方法可降低融合蛋白表征的復(fù)雜性；復(fù)雜融合蛋白的可靠且可重復(fù)的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和絲氨酸殘基的重復(fù)序列組成的柔性連接子。該酶在天然反應(yīng)條件下具有活性，能夠?qū)?fù)雜的融合蛋白進(jìn)行中級(jí)表征。連接子區(qū)域同時(shí)在多個(gè)位點(diǎn)被消化，導(dǎo)致先前連接的組分分離。活性發(fā)生在pH7.6下，孵育時(shí)間可以根據(jù)所需的產(chǎn)物而變化。GlySERIAS是從噬菌體K克隆而來的，在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有His標(biāo)簽，分子量為18kDa。

為什么客戶想在他們的工作試用Genovis的FabRICATOR（IdeS）。FabRICATOR的高特異性(在鉸鏈下方有單個(gè)消化位點(diǎn))以及它對(duì)IgG種和亞類表現(xiàn)出活性的事實(shí)使其成為高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大優(yōu)勢(shì)是速度。在大多數(shù)IgG上，您可以在短短30分鐘內(nèi)生成F(ab’)2和Fc/2片段，這一速度簡(jiǎn)化了方法開發(fā)，并允許快速有效的中層表征，使客戶能夠在不比做完整質(zhì)量實(shí)驗(yàn)長(zhǎng)太多的時(shí)間內(nèi)獲得更多關(guān)于分子的信息。Genovis發(fā)現(xiàn)更多的緩沖液與溶液中的FabRICATOR消解相容（更多信息）。Genovis已經(jīng)測(cè)試了PBS和150mM醋酸銨，pH7，結(jié)果良好。并且應(yīng)該也適用于FabRICATORHPLC。然而，緩沖液的離子強(qiáng)度會(huì)影響抗體片段在FabRICATORHPLC（IdeS）色譜柱上的保留，并且IgG1亞基需要至少100-150mM鹽才能洗脫為單個(gè)窄峰。其他IgG亞類或融合蛋白可能需要對(duì)緩沖液組成進(jìn)行一些優(yōu)化。可消化鉸鏈下方單個(gè)氨基酸位點(diǎn)的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的 F（ab'）2 和 Fc 片段。

與肽圖譜相比，根據(jù)Genovis科學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)，尤其是對(duì)于像抗體這樣的分子，許多人在常規(guī)實(shí)驗(yàn)中做了太多的肽圖譜，而中級(jí)水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級(jí)方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實(shí)際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過程中出錯(cuò)的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺(tái)方法，同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優(yōu)化整個(gè)樣品制備，LC分離，質(zhì)譜設(shè)置和數(shù)據(jù)分析的每個(gè)不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡(jiǎn)單性，中級(jí)方法非常適合自動(dòng)化和高通量的工作流程。肽圖當(dāng)然可以自動(dòng)用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù)，仍然需要徹底分析。事實(shí)上，肽圖譜是一個(gè)多步驟的過程，每一個(gè)步驟都可能破壞方法，并可能導(dǎo)致破壞蛋白質(zhì)的人工制品，很難交叉訓(xùn)練給非專業(yè)人員。中級(jí)水平的方法很容易交叉訓(xùn)練，我們的方法在質(zhì)量控制實(shí)驗(yàn)室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認(rèn)的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級(jí)分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。工藝開發(fā)和潛在生物制藥穩(wěn)定性研究相關(guān)的大量樣品。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

使用GlySERIAS固定化酶和內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR消化度拉糖肽。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

Genovis將固定化酶固定在磁珠上，用于在鉸鏈下方自動(dòng)消化IgG。FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個(gè)氨基酸位點(diǎn)的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。這些微球能夠在中級(jí)表征工作流程中并行快速自動(dòng)酶解多種抗體。它們專為自動(dòng)化平臺(tái)而設(shè)計(jì)，但在無法實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的情況下，在振動(dòng)臺(tái)上的表現(xiàn)同樣出色。酶切消解后，樣品可直接轉(zhuǎn)移到LC-MS的自動(dòng)進(jìn)樣器進(jìn)行快速色譜分析，或轉(zhuǎn)移到其他分析方法進(jìn)行分析。自動(dòng)平行抗體酶切和亞基生成允許處理與克隆選擇、工藝開發(fā)和潛在生物制藥穩(wěn)定性研究相關(guān)的大量樣品。自動(dòng)抗體亞基分析可減少操作人員的時(shí)間和樣品處理錯(cuò)誤的風(fēng)險(xiǎn)，并提高通量。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)