與IdeS不同，Romiplostim 由四個(gè)相同的血小板生成素 （TPO） 受體結(jié)合肽和一個(gè) Fc 片段組成，通過柔性聚甘氨酸序列連接在一起。與度拉糖肽類似，用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下過夜，或用 GlySERIAS 凍干 1 小時(shí)并在 37°C 下過夜消化該蛋白質(zhì)。 鏈間二硫鍵被還原，以便于通過反相LC-MS進(jìn)行以下分析。與度拉糖肽的觀察結(jié)果類似，用固定化酶消化產(chǎn)生均質(zhì)的 Fc/2，剩下一個(gè)連接子殘基，此處為甘氨酸殘基。這有助于識(shí)別專門位于Fc區(qū)域的修改。用凍干酶消化 1 小時(shí)得到 Fc/2，剩余 4 個(gè)甘氨酸殘基和少量的 Fc/2 仍與一個(gè) TPO 肽連接。另一方面，這使得研究 Fc/2 和第yi個(gè)肽之間的連接區(qū)域成為可能，而不會(huì)受到第二個(gè)肽的干擾。用 GlySERIAS 凍干液過夜消化產(chǎn)生 2 個(gè) Fc/2 變體，分別剩下 4 個(gè)和 1 個(gè)甘氨酸殘基。根據(jù)消化時(shí)間的不同，使用凍干產(chǎn)物釋放的肽以五或七種變體存在，接頭中殘留的甘氨酸殘基數(shù)量不同，而使用固定化產(chǎn)物釋放的肽以四種變體存在。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。IgASAP Sub1 是一種 IgA1 特異性酶。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

Blinatumomab（一種對(duì) CD19 和 T 細(xì)胞標(biāo)志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級(jí)生物仿制藥在室溫下用固定化過夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過LC-MS對(duì)消解樣品的直接分析表明，所有三個(gè)連接子區(qū)域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個(gè)色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨(dú)的峰洗脫。來自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結(jié)構(gòu)域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對(duì)短連接子的活性較低。與完整的蛋白質(zhì)分析相比，四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質(zhì)量光譜。可以觀察到每個(gè)結(jié)構(gòu)域的幾個(gè)不同變體，剩余的連接子殘基數(shù)量不同。在色譜分離過程中，α-CD3 VH結(jié)構(gòu)域無法從α-CD19 VH結(jié)構(gòu)域完全基線分離，導(dǎo)致在相關(guān)質(zhì)譜中觀察到一些共洗脫。四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離產(chǎn)生了有關(guān)在完整蛋白質(zhì)水平上鑒定的蛋白質(zhì)修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質(zhì)修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個(gè)修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結(jié)構(gòu)域。后者還含有一個(gè)帶有五六個(gè)組氨酸殘基的 His 標(biāo)簽。這些數(shù)據(jù)證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對(duì)包含多個(gè)柔性連接子蛋白進(jìn)行質(zhì)量控制的中級(jí)工作流程的強(qiáng)大功能。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)Genovis的FabULOUS來源于化膿性鏈球菌，在大腸桿菌中表達(dá)，分子量為 29 kDa，該酶含有 His 標(biāo)簽。

對(duì)于攜帶突變鉸鏈的 Fc 融合蛋白或抗體來說，F(xiàn)ab 和 Fc 片段的生成可能具有挑戰(zhàn)性。Genovis的GingisKHAN酶在鉸鏈上方一個(gè)可觸及的賴氨酸位點(diǎn)消化人IgG1，在足夠溫和的還原條件下保留鏈內(nèi)和鏈間二硫鍵，從而產(chǎn)生完整的Fab和Fc片段。對(duì)于融合蛋白，消化通常在鉸鏈上方獲得，但融合伴侶的結(jié)構(gòu)和氨基酸序列可能導(dǎo)致其他暴露的消化位點(diǎn)。如果去除保守的 Fc N-聚糖，F(xiàn)c 中的第二個(gè)切割位點(diǎn)也可能被GingisKHAN酶切。將精選的單克隆人 IgG1 抗體和 Fc 融合蛋白與 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小時(shí)，并通過 HPLC 進(jìn)行分析。

與IdeS不同，在蛋白質(zhì)zhiliao藥物的質(zhì)量控制過程中，詳細(xì)分析和識(shí)別質(zhì)量屬性非常重要。對(duì)于具有柔性連接子的融合蛋白療法，這包括確認(rèn)連接蛋白的質(zhì)量以及蛋白質(zhì)接頭的質(zhì)量。使用 Genovis的GlySERIAS 的連接子酶切可以通過分離連接的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域來幫助這種質(zhì)量控制。然而，連接子中的大量甘氨酸殘基提供了酶的許多潛在消化位點(diǎn)，導(dǎo)致連接子內(nèi)多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)水解。消化的產(chǎn)物通常由連接蛋白的幾種變體組成，并保留不同程度的連接子。雖然觀察到的異質(zhì)性通常不會(huì)對(duì)蛋白質(zhì)亞基的詳細(xì)表征產(chǎn)生負(fù)面影響，但有助于直接表征連接子，但有時(shí)需要更均勻的消化產(chǎn)物來詳細(xì)分析單個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等傳統(tǒng)酶可用于生成 Fab 片段，但非特異性酶活性需要仔細(xì)優(yōu)化，降低多個(gè)消化位點(diǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。

與肽圖譜相比，根據(jù)Genovis科學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)，尤其是對(duì)于像抗體這樣的分子，許多人在常規(guī)實(shí)驗(yàn)中做了太多的肽圖譜，而中級(jí)水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級(jí)方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實(shí)際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過程中出錯(cuò)的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺(tái)方法，同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優(yōu)化整個(gè)樣品制備，LC分離，質(zhì)譜設(shè)置和數(shù)據(jù)分析的每個(gè)不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡單性，中級(jí)方法非常適合自動(dòng)化和高通量的工作流程。肽圖當(dāng)然可以自動(dòng)用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù)，仍然需要徹底分析。事實(shí)上，肽圖譜是一個(gè)多步驟的過程，每一個(gè)步驟都可能破壞方法，并可能導(dǎo)致破壞蛋白質(zhì)的人工制品，很難交叉訓(xùn)練給非專業(yè)人員。中級(jí)水平的方法很容易交叉訓(xùn)練，我們的方法在質(zhì)量控制實(shí)驗(yàn)室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認(rèn)的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級(jí)分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。可消化鉸鏈下方單個(gè)氨基酸位點(diǎn)的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的 F（ab'）2 和 Fc 片段。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

三個(gè)柔性 GS 連接子均被切開，這有助于識(shí)別Fc區(qū)域的修飾。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶 可用于 IgG 的所有人類亞類以及人源化和嵌合 IgG。該酶對(duì)其他物種的 IgG 也有活性，包括來自大鼠、猴子、兔子和綿羊的某些類別的 IgG。因此，F(xiàn)abRICATOR的高特異性在某些情況下會(huì)使其對(duì)鉸鏈區(qū)域的突變敏感，并損害酶活性。來自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成，與 FabRICATOR 相比，F(xiàn)abRICATOR Z 在消化這些 IgG 方面具有更高的效率。然而，小鼠 IgG1 在鉸鏈下方具有不同的序列，并且不被 FabRICATOR Z 消化。對(duì)于這種抗體種類，F(xiàn)abULOUS 和 FabULOUS Fab 試劑盒可用于制備 Fab 片段。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)