樣品制備的條件可能會在樣品中誘發偽影，因此需要避免高溫和堿性pH值進行質譜分析。如果可能的話，避免多個步驟并在一鍋反應中進行消化和還原也可能是有益的。與IdeS不同，為了探索Genovis的GingisREX對離液劑和去液劑的穩定性和耐受性，在一系列試劑中測試了酶活性，并使用底物測定進行了評估。數據顯示，GingisREX在6M時耐受尿素，吐溫高達1%，但活性在0.1%時受到SDC的負面影響。該酶在 pH 值范圍為 5.0 至 9.0 時顯示出活性，在 pH 值為 6.5-8.0 之間。綜上所述，GingisREX可用于一鍋反應，以同時消化和變性6M尿素。與Genovis的IdeS不同，雙特異性 T 細胞接合器 （BiTE） 分子是一種融合蛋白療法，其中兩個 scFv 融合，形成一個雙特異性分子，其中一個 scFv 靶向細胞毒性 T 細胞，另一個靶向Ai癥抗原。該蛋白質由四個蛋白質結構域組成，兩個 scFv 均由 VL 和 VH 區域組成，總共由三個柔性 GS 連接子連接。這種蛋白質的大尺寸（54 kDa）可能對通過完整質譜法進行產品質量監測構成挑戰，因為標準MS儀器可能無法提供蛋白質的單同位素分辨率。使用GlySERIAS 的連接子酶切可以通過分離連接的蛋白質結構域來幫助這種質量控制。吉林FabRICATOR ZIdeS蛋白酶

大多數商業zhiliao性抗體屬于IgG類，在Fc結構域中含有N-聚糖。一個重要的關鍵質量屬性是糖基化曲線，因為它會影響穩定性、溶解度、藥效學和藥代動力學特性。這種翻譯后修飾可能發生在生物工藝開發和制造過程中，因此需要密切監測。Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶已成為一種被接受的快速表征單克隆抗體（mAb）的分析工具。FabRICATOR在鉸鏈下方消化IgG，產生F（ab'）2和Fc/2片段。單個FabRICATOR消解位點和質量譜的后續精度使Fc糖基化譜能夠檢測，從而可以監測批次間的一致性和其他關鍵質量屬性。吉林FabRICATOR ZIdeS蛋白酶倍篤生物代理多條產品線，用于聚糖分析用酶、ADC偶聯技術、QED抗體對、AAV中和抗體、IdeS蛋白酶等。

LC-MS中級分析是一種被大眾接受的分析方法，用于快速表征mAb和其他基于IgG的生物制藥。它有助于理解多種關鍵質量屬性 （CQA），例如糖基化、氧化和 C 端賴氨酸剪切。這種關于翻譯后修飾（PTM）的詳細知識是生物制藥開發和制造所必需的。Genovis的FabRICATOR HPLC酶色譜柱，可快速進行單克隆抗體的柱上酶切，并產生一致的亞基。該色譜柱含有固定化的FabRICATOR（IdeS）酶，可在鉸鏈下方快速且特異性地消化IgG，產生F（ab'）2和Fc片段，而不會出現任何過度消化的風險。為了減少樣品處理并為樣品制備提供自動化解決方案，FabRICATOR被共價固定在樹脂上，并裝在適用于HPLC的PEEK色譜柱硬件中。使用FabRICATOR HPLC色譜柱，只需稍作修改，即可使用標準HPLC-MS裝置自動生成抗體亞基。然后，FabRICATOR HPLC色譜柱上消解產生的亞基被捕獲在在線連接的反相（RP）色譜柱的柱頭上。

與IdeS不同，Genovis的GingisREX（RgpB）是一種精氨酸特異性蛋白酶，可消化精氨酸殘基的C末端蛋白質，包括難以與其他酶消化的Arg-Pro鍵。該酶可用于肽圖分析、從頭肽測序和翻譯后修飾分析。精氨酸殘基的特異性C-末端消化；在其他困難的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化；產生更長的肽-提高序列覆蓋率。GingisREX是一種半胱氨酸蛋白酶，可特異性地消化肽鍵C末端到精氨酸殘基，包括與脯氨酸相連的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。與胰蛋白酶消化相比，可生成更長的肽，胰蛋白酶消化可以通過高分辨率質譜進行分離和鑒定。這為自下而上方法的樣品制備提供了更多選擇，以實現替代的酶解曲線和更高的序列覆蓋率。GingisREX在賴氨酸上沒有活性，通常使用Arg-C觀察到。該酶在5.0-9.0的寬pH值范圍內具有活性，它需要半胱氨酸并被鹽酸胍抑制。該酶是從牙齦卟啉單胞菌中純化的。GlySERIAS是從噬菌體K克隆而來的，在大腸桿菌中表達。該酶含有 His 標簽，分子量為 18 kDa。

Genovis將固定化酶固定在磁珠上，用于在鉸鏈下方自動消化IgG。FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體，產生均質的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。這些微球能夠在中級表征工作流程中并行快速自動酶解多種抗體。它們專為自動化平臺而設計，但在無法實現自動化的情況下，在振動臺上的表現同樣出色。酶切消解后，樣品可直接轉移到LC-MS的自動進樣器進行快速色譜分析，或轉移到其他分析方法進行分析。自動平行抗體酶切和亞基生成允許處理與克隆選擇、工藝開發和潛在生物制藥穩定性研究相關的大量樣品。自動抗體亞基分析可減少操作人員的時間和樣品處理錯誤的風險，并提高通量。Genovis的FabDELLO作用于人 IgG1 鉸鏈上方的單個暴露賴氨酸殘基。吉林FabRICATOR ZIdeS蛋白酶

用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下凍干消化1 小時。吉林FabRICATOR ZIdeS蛋白酶

Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶 可用于 IgG 的所有人類亞類以及人源化和嵌合 IgG。該酶對其他物種的 IgG 也有活性，包括來自大鼠、猴子、兔子和綿羊的某些類別的 IgG。因此，FabRICATOR的高特異性在某些情況下會使其對鉸鏈區域的突變敏感，并損害酶活性。來自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成，與 FabRICATOR 相比，FabRICATOR Z 在消化這些 IgG 方面具有更高的效率。然而，小鼠 IgG1 在鉸鏈下方具有不同的序列，并且不被 FabRICATOR Z 消化。對于這種抗體種類，FabULOUS 和 FabULOUS Fab 試劑盒可用于制備 Fab 片段。吉林FabRICATOR ZIdeS蛋白酶