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SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit

來源: 發布時間:2024年12月03日

CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質-DNA相互作用的技術,它們有一些關鍵的區別:1.**技術原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技術利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結合來進行DNA切割。ChIC的優勢在于使用TF特異性抗體系住MNase,并只在結合位點裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技術則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復合物,留下寡核小體。CUT&RUN通過在冰上進行簡短的消化反應,在TF結合的MNase擴散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質之前在上清中恢復TF-DNA復合物。2.**操作步驟和簡便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,這可能重新引入了ChIP-seq的一些問題,如交聯導致的DNA和蛋白質的化學修飾。-**CUT&RUN**:CUT&RUN簡化了操作步驟,使用磁珠固定細胞核,適用于新鮮和冷凍組織樣本,縮短了生成DNA測序文庫的時間(1-2天)。3.**背景信號和信噪比**:-**ChIC**:ChIC產生的背景信號可能較高,因為它可能涉及到非特異性的DNA切割。

通過工程化改造,如將FnCas12a與單鏈DNA外切酶融合,可以提高基因編輯效率,擴大FnCas12a可以靶向的范圍 。SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit

SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit,標準物質

在比較BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶對于復雜DNA片段擴增的適用性時,以下是一些關鍵點:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高熱穩定性和擴增效率而被應用于常規PCR。它擴增速度為30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,無校正功能,易產生錯配堿基。-對于結構復雜的模板,如GC含量高、有二級結構等,TaqPlus可以用于擴增,能有效地擴增10kb以下的片段。-有產品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通過基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具備更強大的擴增性能,適合擴增高度復雜的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高適溫度,能夠適應更加苛刻的擴增條件,同時消除DNA二級結構,因而能夠準確并且均勻地擴增全基因組序列。-BstDNA聚合酶大片段能夠優先擴增短片段的DNA,并且能夠確保擴增得到的DNA覆蓋了整個基因組,連貫并且無偏地擴增所有的遺傳位點。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,擴增速度高達10秒/kb,擴增目的片段長達13kb,具有極強的擴增效率的模板適應性,非常適合復雜模板的高保真擴增。

Recombinant Cynomolgus SIRP alpha/CD172a Protein,His TagProbe qPCR Mix (2×)通常含有熱啟動DNA聚合酶,這種聚合酶在高溫下激發,可以減少非特異性擴增 。

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確保Cre重組酶只作用于特定細胞,主要通過以下幾種方式實現:1.**組織特異性啟動子**:-利用組織特異性啟動子控制Cre重組酶的表達,可以確保Cre酶只在特定組織或細胞中表達。這種方法通過將Cre基因置于特定細胞類型特有的啟動子控制之下,實現對Cre酶表達的精確控制。2.**誘導型Cre重組酶系統**:-通過使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實現對Cre活性的時間控制。在無他莫昔芬誘導時,Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結合,定位于細胞質中;當他莫昔芬給藥誘導時,Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進入細胞核發揮基因重組的作用。這種系統相當于為Cre-Lox系統加裝了一個由他莫昔芬控制的外源開關,使得體內基因編輯更具時空靈活性。3.**藥物誘導的Cre系統**:-例如Tet-on系統,通過四環素或其衍生物多西環素的添加來激起基因表達。在三重轉基因動物中,rtTA在特定啟動子的控制下表達,多西環素與rtTA結合,Cre的表達,導致固定的報告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動子的腺相關病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細胞。


質粒DNA提取后的儲存條件對于保持其活性至關重要。以下是一些推薦的儲存方法:1.**干燥保存**:質粒DNA以干粉狀態保存是比較好的方法。如果總DNA以溶液形式保存,可以使用1×TE緩沖液稀釋,且TE緩沖液的pH值應為8.0-8.5之間。2.**低溫保存**:植物總DNA低溫保存比較好在-80℃以下或液氮保存。如果沒有條件,也可以在-20℃保存。總DNA應避免經常凍融,同時建議每份樣品保存3-5個樣本。總DNA提取后保存的時限通常較組織要長(>兩年),但若長期保存,每隔兩年應抽測,對不符合使用要求的DNA進行更新。3.**避免反復凍融**:反復凍融會破壞DNA的完整性和活性,因此應盡量避免。4.**使用保護劑**:化學添加劑如二甲基亞砜(DMSO)可以防止DNA單鏈斷裂,但因其毒性和使用量的問題,并不是理想的保護劑。5.**封裝技術**:通過封裝技術保存DNA,可以隔絕外界水、氧氣和光等可能影響DNA穩定的因素。例如,DNAshell®技術基于密封的不銹鋼微型膠囊,在惰性氣氛下,給予DNA干粉保護。6.**使用穩定劑**:一些天然的雙糖,如海藻糖,被認為是一種多功能的保護劑,可以保護生物體免受冷凍、加熱等不利條件的影響。UBE2L3作為泛素化途徑中的關鍵酶,其在蛋白質降解、信號傳導、細胞周期控制等重要內容有著作用。

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磁珠法提取的DNA通常指的是通過磁珠吸附技術從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個生物體細胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區別在于:1.**來源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質粒DNA、線粒體DNA等其他類型的DNA。它是一個的概念,指的是通過磁珠法技術提取的任何類型的DNA。-基因組DNA特指一個生物體細胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區域。它通常包含了大量的堿基對,如人類基因組由大約30億個堿基對組成。2.**純度和應用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質量取決于提取過程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質量和操作條件。高質量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學實驗,如PCR、克隆、測序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續實驗的準確性。基因組DNA提取的難點在于血液樣本成分復雜,且白細胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術,它利用磁珠表面修飾的特定官能團與核酸的特異性結合,通過外加磁場實現核酸與雜質的快速分離。泛素蛋白的C末端通常通過酰胺鍵與靶蛋白的氨基團連接在一起,最常見的是與靶蛋白賴氨酸的ε氨基團相連。Recombinant Rat PLAU/uPA Protein,His Tag

Cas12a還可以高效地在一些重要的工業鏈霉菌菌株中產生編輯,這些菌株由于毒性而不能使用SpCas9進行編輯。SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit

Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,簡稱λExonuclease)是一種具有特定特性和應用的酶,以下是其主要特點和應用:1.**特異性作用**:λExonuclease是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**酶切活性**:對單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**嗜磷酸性**:該酶具有非常強的嗜磷酸性,磷酸化的核酸鏈與非磷酸化的核酸鏈的切割效率相差達200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一種具有高度持續性的堿性核酸外切酶,可以連續地將核酸切割成為單個堿基,切割比較高速率可以達到1000nt/S。5.**應用領域**:-生成單鏈PCR產物用于DNA測序。-DNA單鏈構象多態性(SSCP)分析。-滾環擴增。-從雙鏈DNA片段生成單鏈DNA。-PCR產物的克隆。-質粒制備凈化。6.**酶活性定義**:Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37oCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit

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