T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應用主要體現在突變體檢測和基因編輯效率評估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應用步驟和特點:1.**基因編輯效率評估**:-T7EI用于評估CRISPR-Cas9在給定的導向RNA靶位點上對細胞群體進行基因編輯的效率。-通過PCR擴增圍繞CRISPR導向RNA靶位點的基因組DNA,如果CRISPR-Cas9介導的非同源末端連接(NHEJ)修復事件引入了突變,變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測**:-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變,則可與野生型DNA片段退火產生異質雙鏈DNA。T7EI可以識別該DNA上的不完全配對的DNA位點然后進行雙鏈切割,通過瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶,從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導致的錯配DNA,不能識別1bp的插入、缺失或突變。3.**實驗步驟**:-收集細胞并提取基因組DNA,然后使用PCR擴增期望編輯的基因組區域。擴增子的長度建議為0.5-1kb。-對擴增的DNA進行變性和退火復性,以產生異質雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產物,在37℃孵育15分鐘。
在PCR實驗中,為了避免引物與已知序列的交叉反應,從而確保實驗的特異性,以下是一些關鍵的引物設計原則和策略:1.**選擇高保守性區域**:引物比較好設計在模板cDNA的保守區內,這樣可以確保引物與目標序列的特異性結合。通過比較不同物種的同一基因序列,可以確定基因的保守區。2.**避免引物與非目標序列的同源性**:設計引物時,應避免與基因組中的重復序列、假基因或高同源性區域設計引物??梢酝ㄟ^BLAST等工具對引物進行同源性分析,確保引物只與目標序列結合。3.**引物長度和GC含量**:引物長度一般在15-30堿基之間,常用的是18-27bp。GC含量一般為40%-60%,以45-55%為宜。過高或過低的GC含量都不利于引發反應,上下游引物的GC含量和Tm值應保持接近。4.**避免引物的3'端錯配**:引物3'端的堿基應嚴格要求配對,特別是倒數第二個堿基,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。引物3'端比較好不要選擇A,比較好選擇T,因為當末位鏈為T時,錯配的引發效率降低。5.**避免引物自身及引物之間的互補序列**:引物自身不應存在互補序列,否則引物自身會折疊成發夾結構,影響引物與模板的復性結合。前后引物之間也不應具有互補性,尤其應避免3'端的互補重疊以防止引物二聚體的形成。Recombinant Cynomolgus SERPINF2/A2AP Protein,His TagPfu DNA Polymerase在基因組測序中的應用:Pfu DNA Polymerase用于基因組測序,確保測序結果的準確性。
在PCR產物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的應用和優勢,但它不能完全替代其他酶。以下是一些替代酶和它們的特點:1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈DNA的平末端、5'-突出末端或切口,從DNA鏈的3'-端釋放5'-單磷酸核苷酸,產生單鏈DNA片段。-與Lambda核酸外切酶相比,ExoIII對具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶則對5'-磷酸化的雙鏈DNA有更高的活性。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP進行“3'dA加尾”,以提高連接效率。-這種方法通過在PCR產物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),增加了與載體連接的可能性,從而提高克隆效率。3.**TOPO克隆載體**:-TOPO克隆載體含有共價連接的DNA拓撲異構酶I,可同時作為限制性內切酶和連接酶。-與傳統PCR克隆載體相比,TOPO克隆載體具有更短的連接反應時間、更高的克隆效率以及更簡單的分子克隆實驗方案。綜上所述,雖然Lambda核酸外切酶在特定情況下非常有用,但它不能完全替代其他酶。每種酶都有其獨特的特性和應用場景,選擇合適的酶取決于具體的克隆需求和實驗設計。
質粒DNA提取后的儲存條件對于保持其活性至關重要。以下是一些推薦的儲存方法:1.**干燥保存**:質粒DNA以干粉狀態保存是比較好的方法。如果總DNA以溶液形式保存,可以使用1×TE緩沖液稀釋,且TE緩沖液的pH值應為8.0-8.5之間。2.**低溫保存**:植物總DNA低溫保存比較好在-80℃以下或液氮保存。如果沒有條件,也可以在-20℃保存??侱NA應避免經常凍融,同時建議每份樣品保存3-5個樣本??侱NA提取后保存的時限通常較組織要長(>兩年),但若長期保存,每隔兩年應抽測,對不符合使用要求的DNA進行更新。3.**避免反復凍融**:反復凍融會破壞DNA的完整性和活性,因此應盡量避免。4.**使用保護劑**:化學添加劑如二甲基亞砜(DMSO)可以防止DNA單鏈斷裂,但因其毒性和使用量的問題,并不是理想的保護劑。5.**封裝技術**:通過封裝技術保存DNA,可以隔絕外界水、氧氣和光等可能影響DNA穩定的因素。例如,DNAshell®技術基于密封的不銹鋼微型膠囊,在惰性氣氛下,給予DNA干粉保護。6.**使用穩定劑**:一些天然的雙糖,如海藻糖,被認為是一種多功能的保護劑,可以保護生物體免受冷凍、加熱等不利條件的影響。Pfu DNA Polymerase在分子進化研究中的應用:Pfu DNA Polymerase用于分子進化研究,確保DNA序列的準確復制。
BstDNA聚合酶在等溫擴增中的優勢主要包括以下幾點:1.**高靈敏度和擴增效率**:BstDNA聚合酶具有鏈置換能力,能夠在恒溫條件下快速、高效、特異性地擴增模板。翌圣生物的BstPlusDNAPolymerase靈敏度超高,低至5copies目的基因可測,且始終能比競品更快達到閾值,擴增速率更快。2.**高dUTP耐受性**:BstPlusDNAPolymerase具有較高的dUTP耐受性,在反應體系中添加dUTP對BstPlusDNAPolymerase的靈敏度及擴增效率無影響,這使得它在防污染系統中表現出色。3.**快速擴增**:使用BstDNA聚合酶的等溫擴增技術,如LAMP,可以在15-60分鐘內實現109-1010倍的擴增,顯示出快速的擴增能力。4.**熱穩定性**:BstDNA聚合酶具有較強的熱穩定性,能在60-65℃的恒溫條件下保持活性,這使得它非常適合于不需要溫度循環的等溫擴增技術。5.**簡化的反應設置**:Bst3.0DNAPolymerase優化了Loop-MediatedIsothermalDNAAmplification(LAMP)反應,簡化了反應設置,可以實現單酶RT-LAMP反應。6.**抗抑制劑能力強**:Bst3.0DNAPolymerase即使在高濃度的擴增抑制劑中,包括dUTP,也能展現出強大的性能。
T4 DNA 聚合酶是一種模板依賴的 DNA 聚合酶,需要特定的 DNA 模板才能進行 DNA 合成反應。Recombinant Human TIMP-2 Protein,His Tag
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種常用于分子生物學實驗的酶,特別是在等溫DNA擴增技術中。以下是一些關于BstDNAPolymerase,LargeFragment的關鍵信息:1.**來源**:這種酶來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),是一種熱穩定的DNA聚合酶。2.**活性**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有5'到3'的DNA聚合酶活性,并且具有鏈置換活性,這使得它能夠用于等溫擴增反應,如環介導等溫擴增(LAMP)。3.**熱穩定性**:由于其嗜熱特性,BstDNAPolymerase,LargeFragment能夠在較高的溫度下保持活性,通常在60-65°C。4.**應用**:-**等溫擴增**:用于LAMP和其他等溫擴增技術,這些技術不需要傳統的熱循環儀。-**全基因組擴增**:用于快速擴增少量DNA樣本,以進行進一步的分析。-**突變檢測**:在某些情況下,用于檢測特定基因的突變。5.**優點**:-**高保真度**:與某些其他DNA聚合酶相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment具有較高的保真度。-**快速擴增**:等溫擴增技術可以在短時間內快速產生大量DNA。Recombinant Human TIMP-2 Protein,His Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin