核酸內(nèi)切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸內(nèi)切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修復(fù)酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的區(qū)別:1.**活性類(lèi)型**:-**核酸內(nèi)切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以釋放受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,產(chǎn)生一個(gè)脫嘌呤(Apurinic,AP)位點(diǎn);AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端,產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。-**核酸內(nèi)切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能夠切割DNA磷二酯骨架在AP位點(diǎn)處,但不具備δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**識(shí)別和切除的受損堿基**:-**核酸內(nèi)切酶VIII**:可以識(shí)別并切除包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲在內(nèi)的多種受損堿基。-**核酸內(nèi)切酶III**:主要識(shí)別和切除氧化性損傷的嘌呤堿基,如8-氧鳥(niǎo)嘌呤。3.**裂解酶活性**:-**核酸內(nèi)切酶VIII**:具有β和δ裂解酶活性,而**核酸內(nèi)切酶III**具有β裂解酶活性。這些區(qū)別決定了它們?cè)贒NA損傷修復(fù)中的作用和應(yīng)用范圍。
Bst Plus DNA Polymerase (40 U/μL) 是一種從嗜熱脂肪芽孢桿菌(Thermophilic Geobacillus sp)DNA聚合酶I衍生的酶,缺乏5'-3'外切核酸酶活性。以下是關(guān)于Bst Plus DNA Polymerase (40 U/μL)的一些關(guān)鍵信息:來(lái)源和特性:Bst Plus DNA Polymerase 具有更強(qiáng)的5'-3' DNA聚合酶活性、鏈置換活性和dUTP耐受性,適合用于抗污染的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP和CPA等。應(yīng)用:主要應(yīng)用于等溫DNA擴(kuò)增,包括環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和其他等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。規(guī)格:活性定義:1 U指的是在65°C下30分鐘內(nèi)將10 nmol的dNTP整合到酸不溶物質(zhì)中的酶的量。溶液成分:包含10 mmol/L Tris-HCl、50 mmol/L KCl、0.1 mmol/L EDTA、1 mmol/L DTT、0.1% Triton X-100、50% 甘油,pH 7.5 @ 25℃。產(chǎn)品形式:提供的產(chǎn)品包括Hieff® Bst Plus DNA Polymerase (40 U/μL),貨號(hào)14402ES,以及凍干粉形式的產(chǎn)品,貨號(hào)14405ES,不含甘油。靈敏度和穩(wěn)定性:Bst Plus DNA Polymerase 具有高靈敏度,低至5copies目的基因可測(cè),且在飛克(fg)級(jí)別的模板量下也能快速達(dá)到閾值。在37°C下,該酶可以保持相對(duì)穩(wěn)定的效應(yīng)長(zhǎng)達(dá)5天,并且在-20℃下可以穩(wěn)定保存2年。儲(chǔ)存條件:建議在-25℃至-15℃下儲(chǔ)存,以保持產(chǎn)品活性,并避免反復(fù)凍融。Recombinant Human BDCA-2 Protein,His Tag在泛素化過(guò)程中,首先泛素激起酶E1(Uba1或其他)在ATP的存在下激起泛素分子,形成E1-泛素硫酯中間體。
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫(kù)中,牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長(zhǎng)的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同,需要靈活運(yùn)用,并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。
T5核酸外切酶在基因編輯中確實(shí)有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢(shì):1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項(xiàng)研究中,通過(guò)使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱(chēng)為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,其中強(qiáng)的親和力CC對(duì)顯示出高的突變頻率和刪除長(zhǎng)度。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類(lèi)型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動(dòng)物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,并引入了核定位信號(hào)(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時(shí)。泛素蛋白是一種在真核細(xì)胞中存在的小分子蛋白質(zhì),由76個(gè)氨基酸殘基組成,具有高度的保守性。
qPCR(定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性可能受到多種因素的影響,以下是一些關(guān)鍵因素:1.**引物和探針設(shè)計(jì)**:引物和探針的設(shè)計(jì)質(zhì)量對(duì)qPCR的成功至關(guān)重要。不合適的引物設(shè)計(jì)可能導(dǎo)致低特異性或效率低的PCR反應(yīng)。引物的選擇應(yīng)考慮引物的長(zhǎng)度、Tm值(解離溫度)和GC含量,以確保其適用于特定的核酸模板。2.**模板質(zhì)量和純度**:模板的質(zhì)量和純度直接影響qPCR的結(jié)果。污染或降解的模板可能導(dǎo)致偏差或虛假陽(yáng)性結(jié)果。使用質(zhì)量高、純度高的DNA或RNA樣本是確保準(zhǔn)確和可靠的qPCR結(jié)果的關(guān)鍵。3.**反應(yīng)條件和緩沖液**:PCR反應(yīng)條件,包括溫度、離子濃度和緩沖液成分,必須嚴(yán)格控制。溫度梯度、離子濃度的變化或緩沖液成分的誤配可能會(huì)影響PCR效率。4.**反應(yīng)容器和耗材**:反應(yīng)管、微孔板、封閉膜等反應(yīng)容器和耗材的質(zhì)量也會(huì)影響qPCR結(jié)果。低質(zhì)量的材料可能導(dǎo)致樣本丟失或反應(yīng)失效。5.**標(biāo)準(zhǔn)曲線和校準(zhǔn)**:標(biāo)準(zhǔn)曲線的準(zhǔn)備和校準(zhǔn)非常重要。不正確的標(biāo)準(zhǔn)曲線可能導(dǎo)致定量結(jié)果的不準(zhǔn)確性。確保標(biāo)準(zhǔn)曲線中包含適當(dāng)?shù)膶?duì)照樣品,并使用線性擬合來(lái)生成準(zhǔn)確的定量數(shù)據(jù)。6.**環(huán)境條件**:實(shí)驗(yàn)室溫度、濕度和空氣質(zhì)量都可以影響qPCR實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。不穩(wěn)定的環(huán)境條件可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不穩(wěn)定性。泛素蛋白的C末端通常通過(guò)酰胺鍵與靶蛋白的氨基團(tuán)連接在一起,最常見(jiàn)的是與靶蛋白賴氨酸的ε氨基團(tuán)相連。Recombinant Mouse Nectin-4 Protein,His Tag
與其他Cas12蛋白相比,F(xiàn)nCas12a蛋白的分子量較小,大約在400-700個(gè)氨基酸之間。Recombinant Human PODXL2 Protein,His Tag
Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在PCR產(chǎn)物的克隆中主要應(yīng)用在以下幾個(gè)方面:1.**單鏈DNA的生成**:-Lambda核酸外切酶可以用于從雙鏈DNA中生成單鏈DNA。由于該酶沿5'→3'方向逐步切去5'單核苷酸,底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,因此可以用來(lái)消化PCR產(chǎn)物中的一條鏈,從而生成單鏈DNA,這對(duì)于某些克隆技術(shù)來(lái)說(shuō)是必要的步驟。2.**PCR產(chǎn)物的克隆**:-在克隆過(guò)程中,有時(shí)需要將PCR產(chǎn)物的5'端磷酸化,以便與載體連接。Lambda核酸外切酶可以消化非磷酸化的DNA,從而在一定程度上幫助準(zhǔn)備適合克隆的PCR產(chǎn)物。3.**減少自身環(huán)化和非特異性連接**:-在連接反應(yīng)中,為了減少質(zhì)粒載體的自身環(huán)化,可以使用堿性磷酸酶處理質(zhì)粒DNA以去除5'磷酸基團(tuán)。而Lambda核酸外切酶可以消化5'端磷酸化的DNA,因此在某些情況下,它可以輔助減少PCR產(chǎn)物的自身環(huán)化,尤其是在PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒載體的連接反應(yīng)中。4.**提高克隆效率**:-通過(guò)消化PCR產(chǎn)物中的一條鏈,Lambda核酸外切酶可以幫助減少PCR產(chǎn)物的非特異性連接,從而提高克隆的效率和準(zhǔn)確性。綜上所述,Lambda核酸外切酶在PCR產(chǎn)物的克隆中主要通過(guò)生成單鏈DNA、準(zhǔn)備適合克隆的PCR產(chǎn)物、減少自身環(huán)化和非特異性連接以及提高克隆效率等方面發(fā)揮作用。Recombinant Human PODXL2 Protein,His Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin