qPCR(定量聚合酶鏈式反應)檢測結果的準確性可能受到多種因素的影響,以下是一些關鍵因素:1.**引物和探針設計**:引物和探針的設計質量對qPCR的成功至關重要。不合適的引物設計可能導致低特異性或效率低的PCR反應。引物的選擇應考慮引物的長度、Tm值(解離溫度)和GC含量,以確保其適用于特定的核酸模板。2.**模板質量和純度**:模板的質量和純度直接影響qPCR的結果。污染或降解的模板可能導致偏差或虛假陽性結果。使用質量高、純度高的DNA或RNA樣本是確保準確和可靠的qPCR結果的關鍵。3.**反應條件和緩沖液**:PCR反應條件,包括溫度、離子濃度和緩沖液成分,必須嚴格控制。溫度梯度、離子濃度的變化或緩沖液成分的誤配可能會影響PCR效率。4.**反應容器和耗材**:反應管、微孔板、封閉膜等反應容器和耗材的質量也會影響qPCR結果。低質量的材料可能導致樣本丟失或反應失效。5.**標準曲線和校準**:標準曲線的準備和校準非常重要。不正確的標準曲線可能導致定量結果的不準確性。確保標準曲線中包含適當的對照樣品,并使用線性擬合來生成準確的定量數據。6.**環(huán)境條件**:實驗室溫度、濕度和空氣質量都可以影響qPCR實驗的結果。不穩(wěn)定的環(huán)境條件可能導致實驗結果的不穩(wěn)定性。FnCas12a需要一個crRNA,而不需要tracrRNA,簡化了RNA的設計和構建過程。Recombinant Human TNFR2/CD120b/TNFRSF1B Protein,mFc Tag
核酸內切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一種來自大腸桿菌的DNA損傷修復酶,具有以下特點:1.**雙功能活性**:核酸內切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**釋放受損嘧啶堿基**:N-糖基化酶活性可以釋放雙鏈DNA上受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一個脫嘌呤(apurinic,AP)位點。3.**切割AP位點**:AP裂解酶活性可以切割AP位點的3'和5'端,產生一個具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。4.**識別并切除受損堿基**:核酸內切酶VIII可以識別并切除多種受損堿基,包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲。5.**與EndonucleaseIII的區(qū)別**:雖然核酸內切酶VIII與核酸內切酶III相似,但核酸內切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸內切酶III具有β裂解酶活性。6.**應用領域**:核酸內切酶VIII可以應用于單細胞凝膠電泳、NGS建庫中DNA損傷修復、酶法合成DNA中釋放DNA鏈、堿洗脫,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)進行含U片段的克隆等。
為了確保PCR實驗中BstDNAPolymeraseI的活性比較大化,以下是一些關鍵的優(yōu)化措施:1.**反應緩沖液**:使用適合BstDNAPolymeraseI的反應緩沖液,如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack,該緩沖液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20,pH值為8.8,專為等溫擴增設計。2.**反應條件**:BstDNAPolymeraseI的比較好反應溫度通常在65°C左右。確保PCR儀能夠精確控制并保持這一溫度,以保證酶的活性和穩(wěn)定性。3.**酶的濃度**:根據反應體系的需要調整BstDNAPolymeraseI的用量。過多的酶可能導致非特異性擴增,而過少則可能降低擴增效率。通常,一個單位的酶能夠在65°C下,30分鐘內將25nmol的dNTP摻入酸不溶性物質。4.**Mg2+濃度**:Mg2+是DNA聚合酶活性的關鍵輔因子。其濃度對PCR反應有影響,需要根據具體情況調整Mg2+濃度,以獲得比較好的擴增效果。5.**dNTPs濃度**:dNTPs是DNA合成的基礎原料,其濃度約為200-300μM較為適宜。過高會增加非特異性擴增。6.**引物設計**:設計特異性引物,通常長度為18-30個堿基,Tm(熔解溫度)相近,以保證同時退火。7.**模板DNA的質量和純度**:確保模板DNA無蛋白質、RNA和其他雜質的污染,這些雜質可能會抑制酶的活性。
牛痘DNA拓撲異構酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實驗室中的使用主要涉及以下幾個步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓撲異構酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價連接形成穩(wěn)定復合物,遇到DNA的5’-OH基團后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫中,牛痘DNA拓撲異構酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實現DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質粒解旋**:將超螺旋質粒DNA與牛痘DNA拓撲異構酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現質粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓撲異構酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現接頭的連接。4.**注意事項**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長的尾巴會導致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應用廣,在不同的實驗中使用策略不同,需要靈活運用,并根據具體文獻進行調整。
Endo H 相對比較嬌貴,需要在特定的條件下保存才能保持其活性,一般需要在 - 20℃或更低溫度下保存。
pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下實驗中特別有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:這是一種用于研究蛋白質-DNA相互作用的技術,pA-MNase在此技術中用于在免疫沉淀后切割染色質DNA,以分析特定蛋白質與DNA的結合位點。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:這是一種蛋白質-基因組互作研究技術,pA-MNase在此技術中用于在目標蛋白質被抗體識別后,通過核酸酶活性切割附近的DNA,從而釋放與目標蛋白質相互作用的DNA片段。CUT&RUN技術相比傳統的ChIP-Seq具有實驗周期短、信噪比高、可重復性好以及細胞投入量低的優(yōu)勢,尤其適用于早期胚胎發(fā)育、干細胞、**以及表觀遺傳學等研究領域。3.**染色質免疫沉淀實驗**:pA-MNase在染色質免疫沉淀實驗中用于染色質片段化,它在核小體間DNAlinker上進行切割保持了核小體的完整性,并且由于其溫和的酶解條件,消除了超聲功率的可變性和超聲過程中染色質乳化所帶來的負面影響。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除細胞裂解液中的核酸,以減少樣品的粘度,這對于后續(xù)的蛋白質分析實驗尤為重要。
在MAGE-A3基因序列的C末端添加His標簽和Avi標簽序列。His標簽有助于通過金屬螯合親和層析進行蛋白純化。Recombinant Human TNFR2/CD120b/TNFRSF1B Protein,mFc Tag
牛痘DNA拓撲異構酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓撲異構酶,具有以下功能和應用:1.**功能**:-牛痘DNA拓撲異構酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價閉合環(huán)狀的正或負超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋,形成含有較少的正或負超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(knotting)或解開繩結(unknotting),聯結互補的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應用**:-作為一種DNA重組連接的新型工具酶,用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術中,DNA拓撲異構酶I同時具有限制酶和連接酶特性,其生物學功能是在復制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制體系反應液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲存條件**:-建議在-25~-15℃保存,有效期為3年。5.**注意事項**:-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓撲異構酶I因其獨特的功能,在分子生物學研究和基因工程中扮演著重要的角色。Recombinant Human TNFR2/CD120b/TNFRSF1B Protein,mFc Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin