使用BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads(血液基因組DNA提取試劑盒,磁珠法)進行血液樣本中基因組DNA的提取,主要步驟如下:1.**實驗準備**:準備抗凝全血樣本(如EDTA抗凝血),移液器及無菌,15ml離心管,無水乙醇,70%乙醇,干凈的吸水紙,渦旋振蕩器,金屬浴/水浴,臺式離心機等。2.**樣本處理**:取適量血液樣本,根據試劑盒要求,可能需要將血液體積調整至特定量,例如200μl,并可能需要加入PBS緩沖液。3.**裂解血液細胞**:向血液樣本中加入蛋白酶K和細胞裂解液,渦旋混勻后,置于金屬浴或水浴中進行裂解,通常在65°C孵育10-15分鐘,并在此期間定期混勻。4.**DNA與磁珠結合**:向裂解后的樣本中加入異丙醇和磁珠懸浮液,渦旋混勻后,室溫放置一段時間,以便于基因組DNA與磁珠結合。5.**磁珠分離**:將樣本置于磁力架上,待磁珠聚集后,小心移除上清液,去除雜質。6.**洗滌磁珠**:向磁珠中加入漂洗液和洗滌液,進行洗滌以去除殘留的蛋白質和鹽分,然后再次使用磁力架分離磁珠,移除洗滌液。
核酸內切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸內切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修復酶,但它們之間存在一些關鍵的區別:1.**活性類型**:-**核酸內切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以釋放受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,產生一個脫嘌呤(Apurinic,AP)位點;AP裂解酶活性可以切割AP位點的3'和5'端,產生一個具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。-**核酸內切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能夠切割DNA磷二酯骨架在AP位點處,但不具備δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**識別和切除的受損堿基**:-**核酸內切酶VIII**:可以識別并切除包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲在內的多種受損堿基。-**核酸內切酶III**:主要識別和切除氧化性損傷的嘌呤堿基,如8-氧鳥嘌呤。3.**裂解酶活性**:-**核酸內切酶VIII**:具有β和δ裂解酶活性,而**核酸內切酶III**具有β裂解酶活性。這些區別決定了它們在DNA損傷修復中的作用和應用范圍。
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學實驗中都是常用的酶,但它們之間存在一些關鍵的不同點:1.**來源和熱穩定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩定性,適用于等溫擴增,如LAMP技術,無需PCR熱循環。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫擴增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴增的應用中。3.**應用領域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術,適用于各種DNA片段的擴增,包括復雜模板和長片段的擴增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫擴增技術,如LAMP,這些技術不需要溫度循環,適用于快速、低成本的DNA擴增。4.**擴增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫擴增中顯示出比傳統TaqDNA聚合酶更快的擴增速度和更高的產量,尤其是在優化的LAMP反應中。
ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端處理上的主要不同點如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,它從DNA鏈的3'-OH末端逐步切去單核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**底物特異性**:-**ExoIII**:適底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于雙鏈DNA切刻位點產生單鏈缺口。由于對單鏈DNA無活性,因此難以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:適底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,對單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**活性差異**:-**ExoIII**:對具有3'-突出末端(至少有4個堿基,且具有3'-末端C殘基)的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活性。-**Lambda核酸外切酶**:對5'-OH端的切割速度比5'-P端慢約20倍;對單鏈DNA的酶切速度比雙鏈DNA慢約100倍。4.**應用場景**:-**ExoIII**:可以用于生產特定方向的單鏈DNA,將線性化DNA設計成為一端為不切割末端(3'突出端),另一端則設計為易切割末端(平端或5'突出端)。
T5核酸外切酶在基因編輯中確實有應用,并且具有一些優勢:1.**提高編輯效率**:根據一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統共表達或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強基因編輯效果**:在另一項研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優于共表達和直接融合,其中強的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應用于多種細胞類型**:CCExo系統在多種細胞系和原代細胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代細胞以及異種移植動物模型中展示了其應用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進行融合,并引入了核定位信號(NLS)序列以構建表達載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應用可以增強編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統結合使用時。通過SDS-PAGE、Western blot、質譜等方法驗證蛋白的純度和分子量。通過活性測試評估蛋白的生物活性。核酸內切酶VIII
Cas12a不僅具有順式切割活性,還具備獨特的反式切割活性,這使得它能夠無差別地裂解附近的單鏈DNA。Recombinant Mouse IL-18 R1/CD218a Protein,His Tag
Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在PCR產物的克隆中主要應用在以下幾個方面:1.**單鏈DNA的生成**:-Lambda核酸外切酶可以用于從雙鏈DNA中生成單鏈DNA。由于該酶沿5'→3'方向逐步切去5'單核苷酸,底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,因此可以用來消化PCR產物中的一條鏈,從而生成單鏈DNA,這對于某些克隆技術來說是必要的步驟。2.**PCR產物的克隆**:-在克隆過程中,有時需要將PCR產物的5'端磷酸化,以便與載體連接。Lambda核酸外切酶可以消化非磷酸化的DNA,從而在一定程度上幫助準備適合克隆的PCR產物。3.**減少自身環化和非特異性連接**:-在連接反應中,為了減少質粒載體的自身環化,可以使用堿性磷酸酶處理質粒DNA以去除5'磷酸基團。而Lambda核酸外切酶可以消化5'端磷酸化的DNA,因此在某些情況下,它可以輔助減少PCR產物的自身環化,尤其是在PCR產物和質粒載體的連接反應中。4.**提高克隆效率**:-通過消化PCR產物中的一條鏈,Lambda核酸外切酶可以幫助減少PCR產物的非特異性連接,從而提高克隆的效率和準確性。綜上所述,Lambda核酸外切酶在PCR產物的克隆中主要通過生成單鏈DNA、準備適合克隆的PCR產物、減少自身環化和非特異性連接以及提高克隆效率等方面發揮作用。Recombinant Mouse IL-18 R1/CD218a Protein,His Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin