在PCR實驗中,除了BsuDNAPolymerase,還有幾種聚合酶適合高溫擴增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,來源于Thermusaquaticus,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,可以承受PCR的熱變性步驟,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來源于Pyrococcusfuriosus,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,提供校正功能,適用于對PCR保真性要求較高的實驗,如基因篩選、克隆表達、突變檢測、定點突變等。3.**VentDNAPolymerase**:來源于Litoralis棲熱球菌,具有3'→5'外切酶活性,可以去除錯配的堿基,具有校對功能,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍。4.**KODDNAPolymerase**:來自Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性比PfuDNAPolymerase更高,優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴增速度達到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**:來源于Bacillusstearothermophilus,具有3'到5'外切割活性,適用于等溫擴增反應(yīng),如LAMP技術(shù),可在恒溫下進行DNA擴增,無需繁瑣的溫度循環(huán)。將Cas9/sgRNA復(fù)合物轉(zhuǎn)染到目標細胞中。可以使用脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染、電穿孔或其他轉(zhuǎn)染技術(shù) 。Recombinant Human DSG-2/Desmoglein-2 Protein,His Tag
磁珠法提取的DNA通常指的是通過磁珠吸附技術(shù)從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個生物體細胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區(qū)別在于:1.**來源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質(zhì)粒DNA、線粒體DNA等其他類型的DNA。它是一個廣的概念,指的是通過磁珠法技術(shù)提取的任何類型的DNA。-基因組DNA特指一個生物體細胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區(qū)域。它通常包含了大量的堿基對,如人類基因組由大約30億個堿基對組成。2.**純度和應(yīng)用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質(zhì)量取決于提取過程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質(zhì)量和操作條件。高質(zhì)量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學(xué)實驗,如PCR、克隆、測序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續(xù)實驗的準確性。基因組DNA提取的難點在于血液樣本成分復(fù)雜,且白細胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術(shù),它利用磁珠表面修飾的特定官能團與核酸的特異性結(jié)合,通過外加磁場實現(xiàn)核酸與雜質(zhì)的快速分離。Recombinant Mouses LAMP5 Protein,hFc TagPfu DNA Polymerase 具有較高的保真度,能夠在DNA合成過程中減少錯誤摻入的堿基,降低非目標突變的發(fā)生率。
在DNA提取過程中避免RNA污染的關(guān)鍵在于采取一系列措施來確保RNA被有效去除或降解,同時保護DNA的完整性和純度。以下是一些確保DNA提取過程中避免RNA污染的策略:1.**使用專門的DNA提取試劑盒**:選擇高質(zhì)量的DNA提取試劑盒,這些試劑盒通常已經(jīng)包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和純化步驟,能夠有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)處理**:在DNA提取過程中加入RNase處理步驟,可以有效地去除殘留的RNA污染。RNase是一種能夠特異性降解RNA的酶,可以在不影響DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**優(yōu)化實驗操作步驟**:在破碎細胞時,選擇合適的破碎方法和破碎時間,避免過度破碎導(dǎo)致RNA的釋放;在DNA純化階段,控制好離心速度和時間,避免RNA的沉淀。4.**使用無RNase的試劑和耗材**:使用經(jīng)過RNase-free處理的實驗器材和試劑,確保實驗過程中不會引入外源性RNA污染。5.**嚴格控制實驗環(huán)境**:保持實驗室臺面和工作區(qū)域干凈無塵,定期對實驗室進行消殺,避免RNA酶污染。6.**個人防護和操作規(guī)范**:在處理DNA樣品時,佩戴無菌手套和口罩,以減少呼吸道和皮膚污染的風(fēng)險。使用不同的工具處理不同的樣品,或者在處理前后徹底清洗工具,避免交叉污染。
BsuDNAPolymerase(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶)在PCR中的應(yīng)用具有多個優(yōu)勢,以下是一些關(guān)鍵點:1.**鏈置換活性**:BsuDNAPolymerase具有很強的鏈置換活性,這使得它非常適合于等溫擴增技術(shù),如重組酶聚合酶擴增(RPA)。在這些技術(shù)中,BsuDNAPolymerase可以快速、高效、特異性地擴增模板,在10到30分鐘內(nèi)將痕量的核酸模板(低至單拷貝)擴增至可以檢出的水平。2.**高溫穩(wěn)定性**:BsuDNAPolymerase在高溫下保持活性,這使得它在一些需要高溫反應(yīng)的實驗條件下表現(xiàn)出色。3.**高靈敏度和特異性**:BsuDNAPolymerase在等溫擴增中展現(xiàn)出高靈敏度,能夠?qū)⑽⒘亢怂崮0鍞U增到可檢測水平。同時,它也具有高特異性,減少了非特異性擴增的風(fēng)險。4.**簡化的樣品處理**:BsuDNAPolymerase可以直接對復(fù)雜樣品進行擴增,無需事先進行復(fù)雜的核酸純化和提取步驟,節(jié)省了時間和成本。5.**可擴增DNA和RNA**:BsuDNAPolymerase不僅可以擴增DNA,還可以直接擴增RNA,省去了額外的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(cDNA合成)步驟,這對于RNA的檢測和分析更加方便快捷。6.**無核酸外切酶和RNase殘留**:BsuDNAPolymerase在生產(chǎn)過程中確保無核酸外切酶、切口酶及RNase殘留,這有助于提高實驗的準確性和重復(fù)性。Tn5 轉(zhuǎn)座酶由兩個化學(xué)性質(zhì)相同的單體組成二聚體,每個單體主要有三個結(jié)構(gòu)域,包括 N 端的 α 螺旋結(jié)構(gòu)域。
牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實驗室中的使用主要涉及以下幾個步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫中,牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長的尾巴會導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實驗中使用策略不同,需要靈活運用,并根據(jù)具體文獻進行調(diào)整。
通過工程化改造,如將FnCas12a與單鏈DNA外切酶融合,可以提高基因編輯效率,擴大FnCas12a可以靶向的范圍 。Recombinant Biotinylated Human MICA Protein,His-Avi Tag
在一項研究中,比較了具有不同NLS融合的Cas9蛋白和Cas9 mRNA在斑馬魚基因組編輯中的效率。Recombinant Human DSG-2/Desmoglein-2 Protein,His Tag
Cre重組酶在基因編輯中的操作主要涉及以下幾個步驟:1.**識別與結(jié)合**:-Cre重組酶首先識別并分別結(jié)合兩個LoxP序列的兩個反向重復(fù)序列,形成一個二聚體。2.**四聚體形成**:-兩個二聚體互相靠近,形成由四個Cre分子與兩個LoxP位點結(jié)合形成的四聚體復(fù)合物。3.**DNA切割與交換**:-Cre重組酶在每個LoxP位點的間隔序列中引導(dǎo)單鏈切割,產(chǎn)生帶有3’端羥基的斷裂。每個LoxP位點的兩個單鏈分別被切割。切割產(chǎn)生的自由3’端與對側(cè)的3’端進行交換和重連,形成Holliday交叉結(jié)構(gòu)。4.**分子重組與解旋**:-Holliday交叉結(jié)構(gòu)通過Cre酶的作用被解旋并重組,形成新的重組產(chǎn)物。這個過程導(dǎo)致兩個LoxP位點之間的DNA序列被刪除、反轉(zhuǎn)或易位,具體效果取決于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**條件性基因編輯**:-通過建立特異性Cre小鼠,該小鼠中的Cre重組酶由特定啟動子驅(qū)動,可在特定細胞或組織或全身表達Cre重組酶。與帶有Lox位點的Flox小鼠雜交,子代中可以獲得既帶有Cre又帶有Flox基因的小鼠,實現(xiàn)條件性基因打靶(表達或敲除靶基因)。Recombinant Human DSG-2/Desmoglein-2 Protein,His Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin