EndoH糖苷內(nèi)切酶H(EndoH)在實(shí)驗(yàn)中通常用于分析以下類型的糖鏈:1.**高甘露糖型糖鏈**:EndoH能夠特異性地識(shí)別并切割高甘露糖型N-連接糖鏈,這些糖鏈通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**某些雜合型糖鏈**:EndoH也能對(duì)某些雜合型寡聚糖的殼二糖結(jié)構(gòu)進(jìn)行切割,去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖。3.**N-連接糖鏈**:EndoH主要用于去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖,這有助于研究糖鏈結(jié)構(gòu)和糖基化模式。4.**抗體糖型分析**:在IgG中,F(xiàn)c區(qū)Asn297處的保守N-連接糖對(duì)其活性至關(guān)重要,EndoH可用于分析這些糖鏈。5.**糖蛋白的糖基化模式**:EndoH有助于分析糖蛋白的糖基化位點(diǎn)、糖基化程度以及糖鏈的具體結(jié)構(gòu)。6.**糖鏈分析和結(jié)構(gòu)表征**:在糖鏈分析的主要策略中,EndoH作為高效、準(zhǔn)確、穩(wěn)定的去糖基化方法,有助于從糖蛋白上游離糖鏈,然后進(jìn)行詳細(xì)的分析表征。EndoH的使用可以為研究者提供關(guān)于糖蛋白糖基化模式的重要信息,尤其是在抗體藥物研究和開發(fā)中,對(duì)于理解糖鏈如何影響藥物的活性、穩(wěn)定性和免疫原性具有重要意義。
在基因編輯中,除了NLS-Cas9-EGFPNuclease,還有多種技術(shù)可以提高編輯的特異性,這些技術(shù)包括:1.**高保真Cas9變體**:通過工程化改造Cas9蛋白,例如使用SpCas9-HF1或eSpCas9等高保真變體,可以減少脫靶效應(yīng),提高特異性。2.**堿基編輯器(BaseEditors)**:這類編輯器可以在不產(chǎn)生DNA雙鏈斷裂的情況下直接在特定位置進(jìn)行單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換,從而減少非目標(biāo)編輯。3.**引導(dǎo)編輯器(PrimeEditors)**:由哈佛大學(xué)劉如謙教授團(tuán)隊(duì)開發(fā)的引導(dǎo)編輯器可以在不依賴DNA雙鏈斷裂和同源定向修復(fù)的情況下,實(shí)現(xiàn)精細(xì)的基因組編輯。4.**CRISPRi和CRISPRa**:這兩種技術(shù)分別用于抑制或激起特定基因的表達(dá),而不切割DNA,從而減少了脫靶風(fēng)險(xiǎn)。5.**新型CRISPR系統(tǒng)**:例如CRISPR/Cas12j和CRISPR/CasΦ,這些系統(tǒng)可能具有不同的PAM序列要求和更高的特異性。6.**AI輔助設(shè)計(jì)**:利用人工智能預(yù)測(cè)和優(yōu)化sgRNA的設(shè)計(jì),以減少脫靶效應(yīng)。7.**優(yōu)化遞送系統(tǒng)**:改進(jìn)CRISPR組分的遞送方法,例如使用核糖核的蛋白(RNP)復(fù)合物,可以提高編輯效率和特異性。8.轉(zhuǎn)座子編輯系統(tǒng):利用轉(zhuǎn)座子進(jìn)行基因組編輯,可以在不依賴DNA雙鏈斷裂的情況下實(shí)現(xiàn)大片段DNA序列的插入。
SpCas9蛋白(來自化膿性鏈球菌的Cas9蛋白)在基因編輯中的主要作用是作為核酸酶,能夠精確地切割目標(biāo)DNA序列。以下是SpCas9在基因編輯中的幾個(gè)關(guān)鍵步驟和作用:1.**識(shí)別和結(jié)合**:SpCas9蛋白與一個(gè)單導(dǎo)向RNA(sgRNA)結(jié)合,形成RNP復(fù)合物。這個(gè)復(fù)合物能夠識(shí)別并結(jié)合到基因組中與sgRNA互補(bǔ)的特定DNA序列。2.**PAM序列識(shí)別**:SpCas9需要一個(gè)稱為原間隔子相鄰基序(PAM)的特定序列作為識(shí)別目標(biāo)DNA的先決條件。對(duì)于SpCas9,這個(gè)PAM序列通常是5'-NGG-3'。3.**DNA切割**:一旦RNP復(fù)合物與目標(biāo)DNA結(jié)合,SpCas9就會(huì)在PAM序列的3個(gè)堿基對(duì)的上游位置切割DNA雙鏈,產(chǎn)生一個(gè)雙鏈斷裂(DSB)。4.**引發(fā)DNA修復(fù)**:DNA雙鏈斷裂觸發(fā)細(xì)胞的DNA修復(fù)機(jī)制,包括同源定向修復(fù)(HDR)和非同源末端連接(NHEJ)。研究人員可以利用這些修復(fù)機(jī)制來插入、刪除或替換特定的DNA序列。5.**基因修改**:通過HDR,可以在斷裂的DNA兩端引入特定的DNA模板,從而實(shí)現(xiàn)精確的基因編輯。而NHEJ通常會(huì)導(dǎo)致小的插入或缺失(indel),這可以用來產(chǎn)生基因的敲除或敲入。6.**提高編輯效率**:為了提高SpCas9的編輯效率,研究人員可能會(huì)使用優(yōu)化的sgRNA設(shè)計(jì)、蛋白質(zhì)工程或嵌合融合蛋白等策略。
通過SDS-PAGE(聚丙烯酰胺凝膠電泳)和Westernblot(西方印跡)可以有效地檢測(cè)帶有His標(biāo)簽的泛素蛋白的純度和完整性。以下是進(jìn)行這些檢測(cè)的步驟:###SDS-PAGE步驟:1.**樣品準(zhǔn)備**:-將重組泛素蛋白溶解在適當(dāng)?shù)木彌_液中,通常含有還原劑(如DTT或β-巰基乙醇)以斷裂二硫鍵。-將樣品在95-100°C下加熱5分鐘以變性蛋白質(zhì)。2.**凝膠準(zhǔn)備**:-根據(jù)需要的分辨率選擇合適的凝膠濃度(例如,12%或15%凝膠用于檢測(cè)20-100kDa的蛋白質(zhì))。3.**上樣**:-將變性后的樣品加入到凝膠的相應(yīng)孔中,同時(shí)加入分子量標(biāo)記物作為參照。4.**電泳**:-在恒定電壓或恒定電流下進(jìn)行電泳,直到樣品在凝膠中充分分離。5.**染色**:-使用考馬斯亮藍(lán)或其他蛋白質(zhì)染色劑對(duì)凝膠進(jìn)行染色,以可視化蛋白質(zhì)條帶。6.**分析**:-通過比較樣品條帶與分子量標(biāo)記物,評(píng)估蛋白質(zhì)的分子量和純度。###Westernblot步驟:1.**轉(zhuǎn)膜**:-將SDS-PAGE分離的蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到PVDF或硝酸纖維素膜上。2.**封閉**:-使用封閉液(如5%脫脂奶粉或1%BSA溶液)封閉膜上未被蛋白占據(jù)的部分,以減少非特異性結(jié)合。3.**一抗孵育**:-使用特異性識(shí)別His標(biāo)簽的抗體(一抗)與膜上的蛋白質(zhì)孵育,通常在4°C過夜。CRISPR/Cas12a 是一種單一的RNA引導(dǎo)的核酸內(nèi)切酶,通過CRISPR/Cas9系統(tǒng)為靶向基因組工程提供了新的機(jī)會(huì)。
PreScissionProtease(PSP)在去除融合蛋白標(biāo)簽時(shí),對(duì)目的蛋白的純度和活性的影響通常是積極的,具體表現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**小化污染**:由于PSP具有高度的特異性,它在特定的肽鍵處切割,從而減少了非特異性切割可能導(dǎo)致的蛋白質(zhì)片段,這有助于保持目的蛋白的純度。2.**減少蛋白質(zhì)修飾**:PSP的特異性切割有助于避免在切割過程中對(duì)目的蛋白引入額外的修飾,如磷酸化或糖基化,這些修飾可能會(huì)影響蛋白質(zhì)的活性和穩(wěn)定性。3.**保持活性**:如果融合蛋白標(biāo)簽的設(shè)計(jì)和切割位點(diǎn)選擇得當(dāng),PSP切割后的目的蛋白通常能夠保持其原有的生物活性。切割位點(diǎn)通常位于標(biāo)簽和目的蛋白之間,這樣切割后不會(huì)在目的蛋白上留下額外的氨基酸,從而減少了對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的影響。4.**提高純度**:PSP切割后,可以通過親和層析等方法將標(biāo)簽、PSP以及未切割的融合蛋白分離,從而獲得高純度的目的蛋白。5.**便于后續(xù)分析**:去除標(biāo)簽后的目的蛋白更易于進(jìn)行后續(xù)的質(zhì)譜分析、晶體學(xué)研究或其他生物化學(xué)分析,因?yàn)槿コ丝赡芨蓴_分析的標(biāo)簽部分。6.**穩(wěn)定性**:在某些情況下,融合蛋白的標(biāo)簽可能有助于穩(wěn)定目的蛋白的構(gòu)象,因此在去除標(biāo)簽后,需要適當(dāng)處理以維持目的蛋白的穩(wěn)定性。Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列,這使得Cas9與gRNA形成的復(fù)合物。Recombinant Mouse BD-1
Multiplex Probe qPCR Mix 已預(yù)混了低濃度ROX參比染料,適用于需要低濃度ROX校正的熒光定量PCR儀 。Recombinant Human CEACAM-3 Protein,hFc Tag
PNGaseF(肽-N-糖苷酶F,Peptide-N-glycosidaseF),也稱為N-糖酰胺酶F,是一種用于糖蛋白研究的酶,它可以從糖蛋白的N-連接糖鏈上去除糖基。以下是PNGaseF的一些關(guān)鍵特性和應(yīng)用:1.**作用機(jī)制**:PNGaseF能夠特異性地切割位于天冬酰胺殘基上的N-連接糖鏈,釋放出未被糖基化的多肽部分和糖鏈。2.**應(yīng)用領(lǐng)域**:PNGaseF在糖生物學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究中非常重要,用于分析糖蛋白的糖基化模式和結(jié)構(gòu)。3.**酶的來源**:PNGaseF開始是從大腸桿菌(Escherichiacoli)中分離出來的,現(xiàn)在也可以通過重組DNA技術(shù)在其他宿主細(xì)胞中表達(dá)。4.**酶的純度和活性**:商業(yè)化的PNGaseF通常具有高純度和高比活性,確保了在實(shí)驗(yàn)中的高效性和可重復(fù)性。5.**使用條件**:PNGaseF在溫和的條件下工作,通常在pH7.5至9.0之間,溫度在37°C左右。6.**穩(wěn)定性**:PNGaseF在儲(chǔ)存時(shí)通常需要冷凍保存,以保持其活性。在適當(dāng)?shù)臈l件下,該酶可以保持穩(wěn)定和活躍。7.**樣品準(zhǔn)備**:在使用PNGaseF之前,糖蛋白樣品需要適當(dāng)準(zhǔn)備,可能包括純化和緩沖液交換,以確保反應(yīng)條件的一致性。Recombinant Human CEACAM-3 Protein,hFc Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin