Cre重組酶在基因編輯中的操作主要涉及以下幾個步驟:1.**識別與結(jié)合**:-Cre重組酶首先識別并分別結(jié)合兩個LoxP序列的兩個反向重復序列,形成一個二聚體。2.**四聚體形成**:-兩個二聚體互相靠近,形成由四個Cre分子與兩個LoxP位點結(jié)合形成的四聚體復合物。3.**DNA切割與交換**:-Cre重組酶在每個LoxP位點的間隔序列中引導單鏈切割,產(chǎn)生帶有3’端羥基的斷裂。每個LoxP位點的兩個單鏈分別被切割。切割產(chǎn)生的自由3’端與對側(cè)的3’端進行交換和重連,形成Holliday交叉結(jié)構(gòu)。4.**分子重組與解旋**:-Holliday交叉結(jié)構(gòu)通過Cre酶的作用被解旋并重組,形成新的重組產(chǎn)物。這個過程導致兩個LoxP位點之間的DNA序列被刪除、反轉(zhuǎn)或易位,具體效果取決于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**條件性基因編輯**:-通過建立特異性Cre小鼠,該小鼠中的Cre重組酶由特定啟動子驅(qū)動,可在特定細胞或組織或全身表達Cre重組酶。與帶有Lox位點的Flox小鼠雜交,子代中可以獲得既帶有Cre又帶有Flox基因的小鼠,實現(xiàn)條件性基因打靶(表達或敲除靶基因)。Probe qPCR Mix (2×)通常含有熱啟動DNA聚合酶,這種聚合酶在高溫下激發(fā),可以減少非特異性擴增 。Recombinant Human LatexinProtein,His Tag
T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點和技術(shù)應用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應用領域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應。7.**儲存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點和技術(shù)應用使得T5核酸外切酶在分子生物學實驗中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應用價值。Growth Hormone Releasing Factor (GHRF)-6E1在ATP的存在下激發(fā)泛素分子,通過一個硫酯鍵將泛素的C末端甘氨酸殘基與E1酶的活性連接起來。
在質(zhì)粒DNA提取過程中,確保DNA的完整性和活性至關重要,這通常涉及以下幾個關鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當?shù)牧呀夥椒▽τ诒3諨NA的完整性至關重要。對于大于15kb的質(zhì)粒DNA,應采用溫和的裂解方法,如將細菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細胞壁和細胞膜,以減少對質(zhì)粒DNA的機械剪切力,從而保護其完整性。2.**避免過度裂解**:在質(zhì)粒提取過程中,并非裂解時間越長越好。過長的裂解時間可能會造成基因組DNA片段的污染,影響質(zhì)粒的純度。3.**適當?shù)南礈旌拖疵?*:在純化過程中,適當?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì),但過度洗滌可能會導致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤柱膜,以保證結(jié)合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時,避免長時間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環(huán),這些都有助于保護DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護DNA的完整性。
T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應用主要體現(xiàn)在突變體檢測和基因編輯效率評估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應用步驟和特點:1.**基因編輯效率評估**:-T7EI用于評估CRISPR-Cas9在給定的導向RNA靶位點上對細胞群體進行基因編輯的效率。-通過PCR擴增圍繞CRISPR導向RNA靶位點的基因組DNA,如果CRISPR-Cas9介導的非同源末端連接(NHEJ)修復事件引入了突變,變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測**:-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變,則可與野生型DNA片段退火產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。T7EI可以識別該DNA上的不完全配對的DNA位點然后進行雙鏈切割,通過瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶,從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導致的錯配DNA,不能識別1bp的插入、缺失或突變。3.**實驗步驟**:-收集細胞并提取基因組DNA,然后使用PCR擴增期望編輯的基因組區(qū)域。擴增子的長度建議為0.5-1kb。-對擴增的DNA進行變性和退火復性,以產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產(chǎn)物,在37℃孵育15分鐘。
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學實驗中都是常用的酶,但它們之間存在一些關鍵的不同點:1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫擴增,如LAMP技術(shù),無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫擴增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴增的應用中。3.**應用領域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴增,包括復雜模板和長片段的擴增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫擴增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴增。4.**擴增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫擴增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應中。
One Step RT-qPCR SYBR Green Kit 是一種用于實時熒光定量PCR的試劑盒,它結(jié)合了反轉(zhuǎn)錄和PCR擴增步驟。Recombinant Human LatexinProtein,His Tag
T5核酸外切酶在基因編輯中確實有應用,并且具有一些優(yōu)勢:1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強基因編輯效果**:在另一項研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達和直接融合,其中強的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應用于多種細胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細胞系和原代細胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血?。–ML)患者的原代細胞以及異種移植動物模型中展示了其應用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進行融合,并引入了核定位信號(NLS)序列以構(gòu)建表達載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應用可以增強編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時。Recombinant Human LatexinProtein,His Tag
Recombinant Human NAP-2/CXCL7
Recombinant Human Coagulation factor XI Protein
Recombinant Human CDCP1 Protein
Recombinant Human FGFR2 alpha(IIIb)(hFc Tag)
Recombinant Biotinylated Mouse TNFSF15 Protein
Recombinant Cynomolgus PVRIG Protein
Recombinant Human IFN-gamma Protein
Recombinant Human PSGL-1 Protein
Recombinant Mouse MDL-1/CLEC5A Protein
Recombinant Human Epiregulin