使用Genovis的OpeRATOR圖譜O-聚糖位點對依那西普進行LC-MS分析:依那西普是一種 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的鉸鏈區域。將依那西普與OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促紅xibao生成素 (EPO) 是一種具有單個 O-糖基化位點的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO進行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通過反相LC-MS分析所得蛋白質片段。O-糖基化的位點可以通過識別OeRATOR消化位點直接推斷出來。為了獲得良好性能,需要去除唾液酸助劑,因此購買中包括2000個單位(如果SialEXO凍干)。1. 用于方法開發的靈活產品形式;2. 可以結合酶以提高效率;3. 適用于自動化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而該酶在N-聚糖上沒有活性。OpeRATOR和SialEXO處理后,O-糖基化蛋白被消化成攜帶O-聚糖的肽。消化發生在O-糖基化位點的N端。ImpaRATOR 凍干劑以凍干粉末的形式提供,裝在 2000 單位小瓶中,用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。江蘇PNGaseF去糖基化酶
Genovis的ImpaRATOR? 可用于多種 O-聚糖:依那西普是一種融合蛋白,由TNF受體的胞外結構域與人IgG1的Fc部分相連。該蛋白質在Fc區域上方含有多達13個O-糖基化的Ser/Thr殘基簇,使其成為一種非常難以在結構上表征的生物制藥。為了證明ImpaRATOR的聚糖特異性,制備了三種具有不同聚糖組成的依那西普樣品:(i)攜帶單唾液酸和二唾液酸化he心1結構混合物的未經處理的糖蛋白,(ii)用SialEXO處理的糖蛋白去除唾液酸并產生裸核1結構,以及(iii)用SialEXO和GalactEXO處理的糖蛋白產生單個GalNAc殘基, 也稱為Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一鍋反應中處理三個樣品(圖1)。作為比較,SialEXO處理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR處理。將所得肽還原、烷基化并用HILIC-MS進行分析。FabRICATOR被包括在反應中,以將Fc區與大多數C端糖肽分離,以促進其表征。山東高活性/無非特異酶活PNGaseF去糖基化酶瑞典GenovisGenvois展示了使用兩種zhiliao蛋白作為底物的OmniGLYZOR的性能:依那西普和促紅xibao生成素 (EPO)。
從依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖:Genovis的GalactEXO Immobilized 對 β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖均具有酶活性,這些半乳糖存在于裝飾有 N- 和 O-連接糖基化的生物制藥中,例如 Fc-融合蛋白依那西普。將依那西普與GalactEXO固定化孵育60分鐘,并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亞基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分別分析。與GalactEXO Immobilized孵育導致N-連接和O-連接聚糖上的半乳糖殘基水解,這在半乳糖基化物種中被視為信號丟失。對游離的N-聚糖分析證實了LC-MS數據。
用于水解β1-3,4-連接半乳糖的固定化酶在離心柱中的糖蛋白上。Genovis的GalactEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價偶聯的GalactEXO酶,用于糖蛋白上β1-3,4-連接半乳糖的水解,而不會用酶污染z終制劑。Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. z終樣品中不含酶。GalactEXO 酶來源于 Akkermansia muciniphila 并重組表達,可有效水解 β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖。GalactEXO微離心柱經過格式化,可在30-60分鐘內水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc);
當在完整狀態下進行分析時,EPO的聚糖異質性導致了非常復雜的質譜圖。通過在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如對應于未修飾蛋白質的單個峰所示。EPO上殘留了少量用乙酰化唾液酸修飾的O-聚糖,因為OmniGLYZOR對這種結構的水解效率低下。根據制造商Genvois的建議(在37°C下進行O/N孵育),兩種底物蛋白也用另一種市售的去糖基化產物處理,并顯示數據以供比較。另一方面,N-聚糖在內質網中翻譯地連接到未折疊的蛋白質上。這導致某些 N-糖基化位點難以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折疊成其天然狀態,就根本無法接近。因此,這種N-聚糖的水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。在變性反應條件下,PNGase F 在 30 分鐘內成功將更復雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。山東高活性/無非特異酶活PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
親和純化微離心柱,SialEXO 凍干 200 單位,OpeRATOR 凍干 200 單位。江蘇PNGaseF去糖基化酶
GlycOCATCH用于純化粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。它是基于無活性的Genovis的OpeRATOR?酶,該酶經過工程改造,可以高親和力結合O-糖基化蛋白和肽。GlycOCATCH的應用包括O糖蛋白和肽的特異性富集或去除、糖組學、復雜樣品的研究和生物制藥的表征。1. 粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽的特異性富集;2. 可靠 - 高親和力結合;3. 快速且易于使用的工作流程。不需要輔助因子或特殊緩沖液。GalNAcEXO中的酶來源于Akkermansia muciniphila,在大腸桿菌中表達,帶有His標簽,分子量為52 kDa。1. 用于方法開發的靈活格式;2. 可以結合酶以提高效率;3. 適用于自動化工作流程; 4. 即用型 - 只需加水即可!用于水解糖蛋白上GalNAc殘基的凍干酶。Genovis的GalNAcEXO凍干劑以凍干粉末的形式提供,裝在2000單位的小瓶中,用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc殘基。江蘇PNGaseF去糖基化酶