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江蘇N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

來源: 發布時間:2024年11月19日

我們測量了FucosEXO從一組dai表不同鍵的不同寡糖底物中釋放的巖藻糖。FucosEXO可有效釋放α1-2、α1-3和α1-4連接的巖藻糖,對α1-6連接的巖藻糖殘基沒有活Genovis的FucosEXO的底物特異性:巖藻糖以不同的鍵存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖常見于 O-聚糖中,并作為 N-聚糖的天線巖藻糖基化,而 α1-6 連接的巖藻糖被發現是 N-聚糖he心的修飾。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。對游離的N-聚糖的分析表明,SialEXO在溶液中完全脫唾液酸化。江蘇N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

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OglyZOR 來源于口腔鏈球菌,在大腸桿菌中表達。該酶含有 His 標簽,分子量為 227 kDa。SialEXO來源于Akkermansia muciniphila,在大腸桿菌中表達。SialEXO酶含有His標簽,組分的分子量分別為42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶;2. 降低樣品異質性,揭示潛在的關鍵蛋白質修飾;3. 完全、穩健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的凍干酶,用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 個單位的小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助劑才能發揮作用,因此與2000單位的SialEXO凍干一起提供。江蘇N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究SialEXO酶來源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達。

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Genovis的PNGase F(肽 N-糖苷酶 F)是一種糖酰胺酶,可水解多肽天冬酰胺與所有哺乳動物天冬酰胺連接復合物、雜交或高甘露糖寡糖的內層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。該酶用于MS分析前的樣品制備,以降低蛋白質異質性并實現游離的聚糖分析,并研究N-聚糖的功能作用。1. 對所有哺乳動物N-聚糖的高效水解;2.對多種糖蛋白具有活性;3.可固定在即用型離心柱產品形式;4. 自動化友好型,96孔板,用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一種 O-糖依賴性蛋白酶,可消化攜帶粘蛋白型。O-聚糖的蛋白質,包括唾液酸化物質、糖基化絲氨酸和 Thr 殘基的 N-末端。該酶產生攜帶 O-糖的糖肽,從而實現 O-糖譜分析、位點占用測定和 O-糖肽圖譜以及使用 LC-MS 分析的中級方法。1. 特異性廣 - 接受多種 O-聚糖變體,包括唾液酸化物種;2. 可靠O-聚糖特異性蛋白酶 – 消化絲氨酸/蘇氨酸糖基化位點的 N 末端;3. 穩健的消化,增強復雜生物制藥的表征。

Genovis的GlycOCATCH?是一種親和樹脂,可特異性結合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,從而實現簡單的工作流程,以富集和純化攜帶O-聚糖的蛋白質和肽。洗滌離心柱,并用8M尿素洗脫結合的蛋白質。對洗脫材料的分析表明,由于洗脫O-糖基化蛋白,并且樹脂與非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的結合可以忽略不計。選擇性結合 O-糖蛋白:為了測試選擇性,將一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白與Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。為了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特異性,將O-glcyosyled肽(糖蛋白)與一系列未修飾的肽混合。SialEXO固定化酶含有與瓊脂糖珠共價偶聯的SialEXO酶,用于糖蛋白的去唾液酸化,而不會被酶污染z終制劑。

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在這里,Genovis分析了 C1 抑制劑——一種人血漿衍生的生物zhiliao藥物,由 6 種 N-聚糖和多達 28 種 O-聚糖修飾,主要由唾液酸he心 1 結構組成。在不對這種高度異質的蛋白質進行任何預處理的情況下,反相LC-MS分析產生了無法詳細解釋的復雜質譜圖。在天然條件下使用OmniGLYZOR Microspin色譜柱,可在3小時內有效去除所有O-聚糖。然而,蛋白質上仍殘留著 1 到 3 個 N-聚糖。使用凍干的PNGase F和OmniGLYZOR試劑盒中包含的MS友好型RapiGest? SF表面活性劑*,在變性條件下通過額外的去糖基化步驟去除這些不可接近的N-聚糖。觀察到所有聚糖的完全去除,但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不會從變性中獲益,這就是為什么OmniGLYZOR Microspin色譜柱只能在非變性條件下使用的原因。OpeRATOR 是一種 O-聚糖特異性蛋白酶,可消化攜帶he心 1 O-聚糖的蛋白質,糖基化(he心 1)Ser 和 Thr 殘基的 N 端。江蘇N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

依那西普和曲妥珠單抗游離聚糖。江蘇N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

水解O-聚糖的酶不會從變性中獲益,這就是為什么OmniGLYZOR色譜柱只能在天然條件下使用的原因。 OmniGLYZOR 試劑盒 Microspin 以含有足夠材料的試劑盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-連接聚糖的快速高效;與LC-MS兼容;完全去除聚糖,改進基礎蛋白的分析;固定形式可提高酶與底物的比率,從而實現快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA?)和PNGaseF酶分別購自Genovis(馬薩諸塞州,美國)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的凍干酶。Genovis的PNGase F 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 1000 或 5 x 1000 單位小瓶中,分別用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。江蘇N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

標簽: 中鹽核酸酶
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