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湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

來源: 發布時間:2024年08月05日

與PNGase F類似,Genvois的OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物,可快速有效地去除抗體、融合蛋白和其他糖基化蛋白上的 N 和簡單的粘蛋白型 O-聚糖。聚糖的去除被用于減少異質性,以促進蛋白質的分析,例如質譜法。去糖基化也可用于研究聚糖的功能作用。N-和粘蛋白型O-連接聚糖的快速高效去糖基化;即用型離心柱形式 - 無酶干擾分析;與LC-MS兼容。與PNGase F類似,Genvois的與PNGase F類似,Genvois的OmniGLYZOR 含有去除 N-糖和最常見的粘蛋白型 O-糖所需的酶,即單唾液酸和二唾液酸he心 1 和 Tn 抗原 (α-GalNAc)。OmniGLYZOR Microspin 小柱中包含以下組分:PNGase?F;O-糖苷酶。用于LC-MS分析之前制備樣品,以鑒定其他PTM或確認氨基酸序列。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

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糖蛋白性能測試:O-聚糖的巖藻糖基化參與功能上重要的聚糖表位的合成,例如血型抗原和劉易斯結構。分析用這種復雜的聚糖結構修飾的糖蛋白可能具有挑戰性,需要高效和特異性的酶工具。我們在許多糖基工程TNFR蛋白上測試了Genovis的FucosEXO,這些蛋白攜帶多達11個O-聚糖,這些O-聚糖以不同的鍵裝飾。我們將該活性與其他市售巖藻苷酶進行了比較。FucosEXO 能夠在 1 小時內對所有三種 TNFR 蛋白進行去巖藻糖磺酸處理,而用其他巖藻糖酶處理導致部分去除巖藻糖或根本沒有去除。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究GalNAcEXO固定化離心柱用于水解糖蛋白上的GalNAc殘基。

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蛋白質的N-糖基化特征是一個關鍵的質量屬性。它會影響生物制藥的安全性和有效性,因此需要在開發和生產過程中進行表征和監測。常見的聚糖分析工作流程是用PNGase F釋放N-聚糖,然后用熒光標記物(如2-AB、2-AA、普魯卡因胺或RapiFluor-MS?(沃特世公司))標記生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛細管電泳分離標記的聚糖,以表征和定量不同的聚糖結構。 在這里,使用游離聚糖方法分析zhiliao性抗體曲妥珠單抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。曲妥珠單抗和依那西普在天然條件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小時,而RNase B需要變性和還原才能完全去糖基化。因此,在50°C下用PNGase F去糖基化10分鐘之前,用RapiGest? SF表面活性劑(沃特世公司)和TCEP處理RNase B。 用RapiFluor-MS標記所得游離的聚糖,并通過HILIC UPLC-FLD-MS進行分析。

Genovis的OglyZOR 是一種內切糖苷酶(O-糖苷酶),可特異性水解天然糖蛋白上的he心 1 O-聚糖。OglyZOR 用于去除 O-糖,用于糖分析、確認 O-糖的存在和降低樣品的異質性。Genovis的OglyZOR 是一種內切糖苷酶(內切-α-N-乙酰半乳糖氨酸酶),可催化來自天然糖蛋白的he心 1 和有限程度的he心 3 O-聚糖的水解。 OglyZOR酶活性需要去除唾液酸,因此,由唾液酸酶混合物組成的唾液酸凍干,用于去除α2-3,α2-6和α2-8連接的唾液酸,與OglyZOR一起提供。在pH 6.5至7.5和37°C下獲得良好活性。PNGase F去除N-糖,被用于MS分析的樣品制備,以降低蛋白質的異質性,分析游離的糖,并研究N-糖的功能作用。

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C1抑制劑的去糖基化:在O-糖基化生物制藥的生產過程中,由于he心GalNAc殘基的加工不完全,可能會出現Tn抗原。這表現為具有 203 Da HexNAc 單位差異的重復質量位移。為了確認 Tn 抗原的存在,可以應用以下工作流程,此處在重度(26 個位點)O-糖基化 C1 抑制劑上演示。首先,使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖,使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能測試?:依那西普是另一種具有挑戰性的生物制藥模型分子,攜帶 13 個 O-聚糖位點,其中平均 9 至 10 個位點被占用。ImpaRATOR 酶不會消化未修飾的絲氨酸或蘇氨酸殘基,也不會在糖蛋白的N-糖基化位點。河南PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

因此,其水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

水解O-聚糖的酶不會從變性中獲益,這就是為什么OmniGLYZOR色譜柱只能在天然條件下使用的原因。 OmniGLYZOR 試劑盒 Microspin 以含有足夠材料的試劑盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-連接聚糖的快速高效;與LC-MS兼容;完全去除聚糖,改進基礎蛋白的分析;固定形式可提高酶與底物的比率,從而實現快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA?)和PNGaseF酶分別購自Genovis(馬薩諸塞州,美國)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的凍干酶。Genovis的PNGase F 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 1000 或 5 x 1000 單位小瓶中,分別用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

標簽: 中鹽核酸酶
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