由于蛋白質的O-糖模式的異質性和O-糖結構的OpeRATOR特異性,形成了重疊的肽,從而可以獲得O-糖位點的完整圖譜為了進行比較,相同材料的標準胰蛋白酶消化物, 顯示難以分析的少量且非常大的糖肽。使用Genovis的OpeRATOR進行O-糖位點定位:OpeRATOR 是一種 O-聚糖特異性蛋白酶,可消化絲氨酸和蘇氨酸糖基化位點的粘蛋白型 O-糖蛋白 N 端。這會產生攜帶O-糖的糖肽,并能夠使用質譜法進行O-糖分析、O-糖肽圖譜以及中級分析。下面是OpeRATOR消解位點的示意圖。使用OpeRATOR圖譜O-聚糖位點對依那西普進行LC-MS分析。重慶N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物學研究
經過多年的經驗積累及市場積淀,倍篤生物已組合多條不同產品線,分別滿足體外診斷、organoid及干細胞、細胞基因藥物等領域的需求。其中,細胞基因藥物領域產品線包含SAN HQ高鹽核酸酶及M-SAN HQ中鹽核酸酶、泊洛沙姆P 188 Bio、GMP級MSC/PSC培養基、GMP級膠原酶、AAV滴度檢測產品、工藝雜質及外源污染物殘留檢測產品、聚糖分析用酶、ADC偶聯技術、QED抗體對、AAV中和抗體、蛋白酶等;相關品牌有挪威ArcticZymes Technologies、德國BASF、德國Sartorius、德國Nordmark、瑞典Genovis、美國QED、中國君研生物等。廣東凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究將OglyZOR酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒有 SialEXO 孵育 1 小時。
Fc N-聚糖在抗體的效應功能中起著至關重要的作用,但可能會增加蛋白質表征測定的復雜性。在天然條件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游離N-糖以及去糖基化抗體的功能和結構。 為了證明PNGase F固定化和PNGase F凍干在天然反應條件下有效去除Fc N-聚糖,對zhiliao性抗體曲妥珠單抗進行了處理。圖2中的質量數偏移表明,在37°C下用Genovis的PNGase F凍干或PNGase F固定化孵育1小時后,曲妥珠單抗上的Fc N-聚糖成功去除,與在溶液中用PNGase F凍干處理的樣品相比,沒有酶干擾用PNGase F固定處理的樣品的分析。
Core 1型O-聚糖的水解:O-糖基化不僅難以研究,其自然異質性也會導致其他分析出現問題。例如,由于樣品中存在許多不同的糖型,因此對完整或中等水平的重糖基化蛋白質進行質譜分析可能非常困難。酶法去除N-聚糖的解決方案已經存在多年,Genvois的PNGase F是一種非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑戰性,現有的O-糖釋放化學方法通常會導致蛋白質發生重大修飾,因此不太適合下游分析。1. 用于方法開發的靈活產品形式;2. 可以結合酶以提高效率;3. 適用于自動化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。PNGase F 固定化微離心柱含有與瓊脂糖珠共價偶聯的 PNGase F 酶,用于在z終樣品中酶峰減少的糖蛋白上水解 N-糖。
Genovis的GlycOCATCH?是一種親和樹脂,可特異性結合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,從而實現簡單的工作流程,以富集和純化攜帶O-聚糖的蛋白質和肽。洗滌離心柱,并用8M尿素洗脫結合的蛋白質。對洗脫材料的分析表明,由于洗脫O-糖基化蛋白,并且樹脂與非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的結合可以忽略不計。選擇性結合 O-糖蛋白:為了測試選擇性,將一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白與Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。為了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特異性,將O-glcyosyled肽(糖蛋白)與一系列未修飾的肽混合。對天然糖蛋白或游離的聚糖結構上存在的 N- 和 O-連接聚糖均具有活性。四川瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶生物藥物開發
PNGase F(肽 N-糖苷酶 F)是一種糖酰胺酶,可水解內層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。重慶N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物學研究
與PNGase F類似,Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖:糖基化往往是異質的,這使得對高度糖基化的生物zhiliao藥物的分析具有挑戰性。完整質量數的確認以及其他產品質量屬性的表征受到不同糖型復雜性的阻礙,這就是為什么有效的聚糖去除工具簡化了此類分析的原因。 雖然 N-聚糖包含一個共同的結構,并且可以通過 PNGase F 整體去除,但粘蛋白型 O-聚糖在結構上更加多樣化,具有多個不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物,能夠依次分解O-聚糖,以完全去除最常見的O-聚糖結構(二唾液酸和單唾液酸基he心1和Tn抗原)。重慶N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物學研究